家鵝mtDNA D-環(huán)區(qū)部分序列分析和系統(tǒng)進(jìn)化研究.pdf

1、線粒體DNA序列分析技術(shù)使我們對(duì)人類及家養(yǎng)動(dòng)物的起源進(jìn)化和系統(tǒng)發(fā)育有了更深入細(xì)致的了解。在線粒體DNA上，D-環(huán)是整個(gè)線粒體基因組序列和長(zhǎng)度變異最大的區(qū)域，其進(jìn)化速度最快，一般用于種內(nèi)種群間的系統(tǒng)研究。本試驗(yàn)通過(guò)對(duì)8個(gè)家鵝品種以及野生鵝種鴻雁共143個(gè)個(gè)體mtDNAD-環(huán)的部分序列研究，在分子水平上探討家鵝的起源和遺傳多樣性，為家鵝品種遺傳資源的保護(hù)和利用提供科學(xué)理論依據(jù)。
　　 本研究采用clsutalX軟件進(jìn)行同源序列比對(duì)：

2、Dnasp4.01軟件用于遺傳多樣性分析、計(jì)算單倍型多樣度、核苷酸多樣度，平均核苷酸差異；MEGA4.1軟件用于采用鄰接法(NJ)和非加權(quán)組平均法(UPGMA)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)，并進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析；Network軟件用于網(wǎng)絡(luò)關(guān)系分析。
　　 對(duì)中國(guó)8個(gè)家鵝品種及野生鴻雁143個(gè)個(gè)體的mtDNAD-環(huán)部分序列(490bp)進(jìn)行測(cè)序，T、C、A、G堿基平均含量分別為27.2％、30.7％、22.9％、19.2％；以白額鵝線粒體基因

3、組為對(duì)照進(jìn)行分析，結(jié)果表明：家鵝8個(gè)品種及野生鵝種鴻雁143個(gè)個(gè)體490bp序列共檢測(cè)到核苷酸多態(tài)位點(diǎn)17個(gè)。所有變異位點(diǎn)均為轉(zhuǎn)換位點(diǎn)，其中單一多態(tài)位點(diǎn)有6個(gè)，簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)有10個(gè)，含有三個(gè)變異的堿基多態(tài)位點(diǎn)1個(gè)。
　　 143個(gè)序列由6個(gè)單倍型組成，單倍型比例為4.20％，在羅曼鵝中發(fā)現(xiàn)了一條稀有單倍型H6。鴻雁單倍型比例最高為66.67％，其次為浙東白鵝30.77％，陽(yáng)江鵝單倍型比例最低為4.76％。
　　 對(duì)不同單