杜洛克豬飼料利用效率參數(shù)估計及候選基因HLCS關聯(lián)分析.pdf

1、飼料成本占養(yǎng)豬成本的70％以上，尤其是在大規(guī)模集約化生產(chǎn)的情況下，飼料利用效率的重要性更是不言而喻?，F(xiàn)階段飼料利用效率的改良是遺傳育種學家對豬進行持續(xù)生長速度和背膘厚選擇的間接反應。與國外的豬的育種工作相比，我國豬育種的基礎參數(shù)研發(fā)及應用方面還存在著諸多基礎工作滯后，飼料利用的測定長期借鑒國外，沒有結合我國的實際情況，同時由于我國豬場數(shù)量龐大，測定獲得的大量數(shù)據(jù)缺乏統(tǒng)一的測定規(guī)范和標準，這樣獲得數(shù)據(jù)并不能直接用于遺傳評估。同時飼料利用效

2、率是一個復雜的性狀，主效基因及其調控機制仍沒有明確定論。因此本研究利用全期測定的1292頭美系杜洛克為研究對象，分析飼料利用效率的測定階段、制定RFI校正公式并在前期GWAS研究的基礎上進行候選基因的進一步分析。主要研究內容及結果如下:
　　1.利用SAS軟件通過四種不同的計算方法分別計算90-180d、105-180d、120-180d、135-180d、150-180d、165-180d六個階段的RFI及各個階段的相關性，結果

3、表明:不同計算公式下，均是105-180d和全期的相關性最高，適配回歸方程極顯著(P＜001)，擬合度較高，達到了0.9734。說明105-180d測定階段替代全期測定的方法用于早期飼料利用的選擇是可行的。
　　2.利用MTDFREML軟件對杜洛克群體的飼料利用效率相關性狀:剩余采食量(RFI，Residualfeed intake)、飼料轉化率(FCR，F(xiàn)eed conversion ratio)、平均日采食量(ADFI，Ave

4、rage daily feedintake)、平均日增重(ADG，Average daily gain)、100Kg背膘(100KgBF，100Kg Back fat)、90日齡體重(90dBW，90d Body weight)、180日齡體重(180dBW，180d Body weight)、代謝中間體重(MBW，Metabolism middle body weight)、眼肌面積(LEA，Loin eye area)、總采食量(T

5、FI，Total feed intake)、總采食次數(shù)(TNT，Total number of times)和總采食時間(TFT，Total feed time)進行描述性統(tǒng)計、遺傳力、遺傳相關和表型相關分析。結果表明這些性狀都為中等遺傳力性狀，遺傳力介于0.18～0.46之間。RFI性狀與FCR和ADFI的遺傳及表型相關性比較高;FCR與RFI、ADFI和ADG的遺傳相關和表型相關性比較高。
　　3.采用線性插值及SAS的NLI

6、N過程對杜洛克豬100Kg RFI制定校正公式，得出公母豬校正系數(shù)分別為0.0519、0.0179。然后利用此校正系數(shù)，計算出早期性狀的校正值和全期性狀的校正值，并做簡單相關和典型相關分析，結果表明:相關系數(shù)達到極顯著水平(P＜0.01)。
　　4.前期全基因組關聯(lián)分析(GWAS)結果顯示:最顯著位點ASGA0059961位于HLCS基因內?；谏鲜鲅芯拷Y果，本部分試驗選擇HLCS基因作為影響豬RFI性狀的候選基因進行深入研究?；?/p>

7、池測序、質譜分析并與飼料利用效率進行關聯(lián)分析。結果發(fā)現(xiàn):HLCS基因的啟動子區(qū)發(fā)現(xiàn)一個SNP位點rs417014705 G＞A與杜洛克豬RFI、ADFI、FCR、TFI極顯著相關(P＜0.01)。卡方檢驗結果表明:rs417014705 G＞A位點具有低度的遺傳多樣性，其基因頻率和基因型頻率在試驗杜洛克群體中未達到Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。以上結果表明，可將豬HLCS基因的rs417014705 G＞A位點作為育種工作中豬飼