杜洛克豬飼料利用效率參數(shù)估計(jì)及候選基因HLCS關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、飼料成本占養(yǎng)豬成本的70％以上，尤其是在大規(guī)模集約化生產(chǎn)的情況下，飼料利用效率的重要性更是不言而喻。現(xiàn)階段飼料利用效率的改良是遺傳育種學(xué)家對(duì)豬進(jìn)行持續(xù)生長(zhǎng)速度和背膘厚選擇的間接反應(yīng)。與國(guó)外的豬的育種工作相比，我國(guó)豬育種的基礎(chǔ)參數(shù)研發(fā)及應(yīng)用方面還存在著諸多基礎(chǔ)工作滯后，飼料利用的測(cè)定長(zhǎng)期借鑒國(guó)外，沒(méi)有結(jié)合我國(guó)的實(shí)際情況，同時(shí)由于我國(guó)豬場(chǎng)數(shù)量龐大，測(cè)定獲得的大量數(shù)據(jù)缺乏統(tǒng)一的測(cè)定規(guī)范和標(biāo)準(zhǔn)，這樣獲得數(shù)據(jù)并不能直接用于遺傳評(píng)估。同時(shí)飼料利用效

2、率是一個(gè)復(fù)雜的性狀，主效基因及其調(diào)控機(jī)制仍沒(méi)有明確定論。因此本研究利用全期測(cè)定的1292頭美系杜洛克為研究對(duì)象，分析飼料利用效率的測(cè)定階段、制定RFI校正公式并在前期GWAS研究的基礎(chǔ)上進(jìn)行候選基因的進(jìn)一步分析。主要研究?jī)?nèi)容及結(jié)果如下:
　　1.利用SAS軟件通過(guò)四種不同的計(jì)算方法分別計(jì)算90-180d、105-180d、120-180d、135-180d、150-180d、165-180d六個(gè)階段的RFI及各個(gè)階段的相關(guān)性，結(jié)果

3、表明:不同計(jì)算公式下，均是105-180d和全期的相關(guān)性最高，適配回歸方程極顯著(P＜001)，擬合度較高，達(dá)到了0.9734。說(shuō)明105-180d測(cè)定階段替代全期測(cè)定的方法用于早期飼料利用的選擇是可行的。
　　2.利用MTDFREML軟件對(duì)杜洛克群體的飼料利用效率相關(guān)性狀:剩余采食量(RFI，Residualfeed intake)、飼料轉(zhuǎn)化率(FCR，F(xiàn)eed conversion ratio)、平均日采食量(ADFI，Ave

4、rage daily feedintake)、平均日增重(ADG，Average daily gain)、100Kg背膘(100KgBF，100Kg Back fat)、90日齡體重(90dBW，90d Body weight)、180日齡體重(180dBW，180d Body weight)、代謝中間體重(MBW，Metabolism middle body weight)、眼肌面積(LEA，Loin eye area)、總采食量(T

5、FI，Total feed intake)、總采食次數(shù)(TNT，Total number of times)和總采食時(shí)間(TFT，Total feed time)進(jìn)行描述性統(tǒng)計(jì)、遺傳力、遺傳相關(guān)和表型相關(guān)分析。結(jié)果表明這些性狀都為中等遺傳力性狀，遺傳力介于0.18～0.46之間。RFI性狀與FCR和ADFI的遺傳及表型相關(guān)性比較高;FCR與RFI、ADFI和ADG的遺傳相關(guān)和表型相關(guān)性比較高。
　　3.采用線性插值及SAS的NLI

6、N過(guò)程對(duì)杜洛克豬100Kg RFI制定校正公式，得出公母豬校正系數(shù)分別為0.0519、0.0179。然后利用此校正系數(shù)，計(jì)算出早期性狀的校正值和全期性狀的校正值，并做簡(jiǎn)單相關(guān)和典型相關(guān)分析，結(jié)果表明:相關(guān)系數(shù)達(dá)到極顯著水平(P＜0.01)。
　　4.前期全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)結(jié)果顯示:最顯著位點(diǎn)ASGA0059961位于HLCS基因內(nèi)。基于上述研究結(jié)果，本部分試驗(yàn)選擇HLCS基因作為影響豬RFI性狀的候選基因進(jìn)行深入研究?；?/p>

7、池測(cè)序、質(zhì)譜分析并與飼料利用效率進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn):HLCS基因的啟動(dòng)子區(qū)發(fā)現(xiàn)一個(gè)SNP位點(diǎn)rs417014705 G＞A與杜洛克豬RFI、ADFI、FCR、TFI極顯著相關(guān)(P＜0.01)?？ǚ綑z驗(yàn)結(jié)果表明:rs417014705 G＞A位點(diǎn)具有低度的遺傳多樣性，其基因頻率和基因型頻率在試驗(yàn)杜洛克群體中未達(dá)到Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。以上結(jié)果表明，可將豬HLCS基因的rs417014705 G＞A位點(diǎn)作為育種工作中豬飼