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文檔簡介
1、水稻細菌性條斑病菌(Xanthomonas oryzae pathovar oryzicola,Xoc)引起的水稻細條病對廣西部分地區(qū)水稻產(chǎn)量造成影響。隨著水稻與Xoc菲律賓代表菌株BLS256相繼測序成功,Xoc—水稻的互作已成為研究病原菌—植物互作的模式之一。廣西菌株GX01的測序也基本完成,如此豐富的靜態(tài)堿基序列信息正等待著我們從中挖掘動態(tài)的病原菌生物學(xué)功能。突變體庫是功能基因組學(xué)研究的基礎(chǔ),轉(zhuǎn)座子可移動及可體外驅(qū)動轉(zhuǎn)座的特點被廣
2、泛應(yīng)用于介導(dǎo)插入突變體庫的構(gòu)建,逐漸成為一個研究黃單胞菌的強大工具。
本研究以廣西菌株Xoc GX01作為建庫出發(fā)菌株,利用EZ-Tn5TM
3、力減弱的突變體31個,胞外蛋白酶活性增強的突變體77個,胞外蛋白酶活性減弱的突變體16個,游動性增強的突變體61個,游動性減弱的突變體507個,并發(fā)現(xiàn)出現(xiàn)生物膜現(xiàn)象的突變體67個。
為了驗證確實有轉(zhuǎn)座子的插入,我們從突變體庫中隨機選取了17個突變體,提取它們的總DNA,用鑒定引物PCR驗證,均能擴增出568 bp的目的產(chǎn)物,證明這些轉(zhuǎn)化子均有Tn5插入,假陽性率低。并利用質(zhì)粒拯救的方法進一步獲取其轉(zhuǎn)座子的側(cè)翼序列,與Xoc
4、GX01全基因組進行本地序列比對(BLAST),相似性百分比在97%以上,側(cè)翼序列的真實性比較高,是一種相對高效的定位方法。
同時,我們從篩庫過程中選取表型變化相對明顯的突變體BH90和BA87進行致病力檢測,它們的致病力均有不同程度的下降,其定位信息分別為XOC2200和XOC2216。為進一步研究這兩個基因的功能,同時構(gòu)建了XOC2200和XOC2216的缺失突變體及其互補菌株。XOC2200的編碼產(chǎn)物為Transcr
5、iptional regulator,flagellar regulatoryprotein A; XOC2216的編碼產(chǎn)物為flagellar biosynthesis hook protein。其中Tn5插入突變體BH90及XOC2200的缺失突變體胞外多糖及游動性顯著提高,互補菌株表型基本能夠恢復(fù)到野生型狀態(tài),推測XOC2200可能反向調(diào)控胞外多糖的合成及Xoc的游動性。Tn5插入突變體BA87及XOC2216的缺失突變體胞外蛋白
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