基于計(jì)算系統(tǒng)生物學(xué)擬南芥花粉管與柱頭乙醇代謝耦合模型.pdf

1、植物傳粉與受精是種子和果實(shí)產(chǎn)生及作物產(chǎn)量形成的基礎(chǔ)，闡明植物傳粉與受精的調(diào)控機(jī)制是生殖與發(fā)育生物學(xué)研究領(lǐng)域重要和熱點(diǎn)問題之一。
　　本文以模式植物“擬南芥”作為研究對(duì)象:
　　(1)收集、整理擬南芥已有的代謝途徑數(shù)據(jù)庫(kù)及擬南芥花粉管與柱頭互作過程中的多組學(xué)數(shù)據(jù);
　　(2)依據(jù)生物生化反應(yīng)方程式及代謝互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建模式，構(gòu)建了擬南芥全基因代謝互作網(wǎng)絡(luò)模型;
　　(3)依據(jù)擬南芥花粉管與柱頭互作過程中的全基因轉(zhuǎn)錄組數(shù)

2、據(jù)，分別挖掘出擬南芥花粉管和柱頭在授粉過程中特異表達(dá)的基因，并進(jìn)一步找到了這些特異表達(dá)基因所編碼的酶;
　　(4)然后根據(jù)代謝網(wǎng)絡(luò)模型構(gòu)建規(guī)則，將花粉管和柱頭中差異基因編碼的酶匹配到已構(gòu)建的擬南芥全基因代謝互作網(wǎng)絡(luò)中，提取出由差異基因編碼的酶構(gòu)成的子網(wǎng)絡(luò);
　　(5)再采用網(wǎng)絡(luò)拓?fù)渲泄?jié)點(diǎn)的關(guān)聯(lián)性、中心節(jié)點(diǎn)等網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浞治龇椒?，得到了擬南芥花粉管中乙醇二級(jí)代謝和檸檬酸循環(huán)代謝途徑上的特異表達(dá)的酶基因以及柱頭中糖酵解代謝途徑上的特