下司犬線粒體DNA及主要組織相容性復(fù)合物的遺傳多樣性研究.pdf

1、采用PCR（Polymerase Chain Reaction，聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)）擴(kuò)增和測(cè)序方法獲得下司犬線粒體DNA的D-loop序列，發(fā)現(xiàn)其D-loop5’端高變區(qū)Ⅰ582bp堿基序列的A+T含量明顯高于G+C含量，表現(xiàn)出強(qiáng)烈的反G偏倚。并于下司犬高變區(qū)Ⅰ序列共檢測(cè)到11個(gè)多態(tài)位點(diǎn)，構(gòu)成7種單倍型，單倍型多樣性為0.867，說明下司犬線粒體D-loop的單倍型類型豐富，但其高變區(qū)Ⅰ的核苷酸多樣性（Pi=0.00519）和平均核苷酸差異

2、（k=3.002）卻提示，下司犬的遺傳多樣性較低。聚類分析結(jié)果顯示，中國(guó)家犬有3個(gè)母系來源，下司犬與藏獒的親緣關(guān)系最近，建議將藏獒用于下司犬的選育和復(fù)壯。
　　家犬的主要組織相容性復(fù)合體（Major histocompatibility complex，MHC）又稱為犬白細(xì)胞抗原（Dog leukocyte antigen，DLA）。本研究利用PCR-SSCP（Single stranded conformation polymo

3、rphism，單鏈構(gòu)象多態(tài)性）技術(shù)檢測(cè)了下司犬等4個(gè)品種，46只家犬個(gè)體的主要組織相容性復(fù)合體DRB1基因第二外顯子（DLA-DRB1exon2）的序列變異。目的DNA經(jīng)SSCP分型后克隆測(cè)序，獲得270bp的目的基因片段。與已知等位基因比較發(fā)現(xiàn)，本文所測(cè)序列共有62個(gè)多態(tài)位點(diǎn)，定義了53個(gè)等位基因，其中48個(gè)為新發(fā)現(xiàn)等位基因。所有序列中都沒有發(fā)現(xiàn)序列的插入或缺失，經(jīng)等位基因序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)，非同義替換導(dǎo)致39個(gè)氨基酸改變。家犬主要組織相容