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文檔簡介
1、本研究比較了兩種基因組提取方法對(duì)調(diào)查沉積物中細(xì)菌群落垂向特征的影響,并研究了中營養(yǎng)化湖泊洱海的不同湖區(qū)沉積物中細(xì)菌群落組成,功能與不同有機(jī)質(zhì)來源的關(guān)系。研究中我們利用了PCR-變形梯度凝膠電泳技術(shù)(DGGE),碳同位素(δ13C)和碳氮原子比測定以及典范對(duì)應(yīng)分析(CCA)來研究沉積物中細(xì)菌群落進(jìn)化與環(huán)境變量的關(guān)系,特別是與有機(jī)質(zhì)來源的關(guān)系。我們的實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明不同的基因組提取方法對(duì)產(chǎn)生的細(xì)菌群落組成信息具有顯著的影響,但不會(huì)影響底泥垂向群
2、落結(jié)構(gòu)與環(huán)境變量關(guān)系的評(píng)價(jià),方法導(dǎo)致的核酸產(chǎn)量差異主要體現(xiàn)在深層底泥中。另外不同湖區(qū)的沉積物細(xì)菌群落垂向變化受不同環(huán)境因子的影響,但是有機(jī)質(zhì)來源在不同區(qū)域?qū)?gòu)建細(xì)菌群落組成都發(fā)揮了重要作用。伴隨著陸源C4植物來源有機(jī)質(zhì)含量增長,Delta-變形桿菌(Deltaproteobacteria)的豐度會(huì)下降。本研究對(duì)DGGE條帶進(jìn)行了克隆測序,結(jié)果表明洱海底泥中大多數(shù)細(xì)菌屬于:Delta-變形桿菌(Deltaproteobacteria),厚
3、壁菌(Firmicutes)綠屈撓菌(Chloroflexi)。Beta-變形桿菌(Betaproteobacteria)只做為上層底泥優(yōu)勢菌而出現(xiàn)。本研究對(duì)沉積物細(xì)菌群落組成分析也表明洱海北部的營養(yǎng)化程度相對(duì)其他區(qū)域更高。細(xì)菌群落的香農(nóng)威爾多樣性指數(shù)和功能也直接受到有機(jī)質(zhì)來源影響,恒定的有機(jī)質(zhì)來源會(huì)產(chǎn)生穩(wěn)定的,多樣化程度更高的細(xì)菌群落以及更廣泛的利用有機(jī)質(zhì)的能力和策略??偠灾?,細(xì)菌群落多樣性差異很大程度上歸因于環(huán)境變化后不同的有機(jī)質(zhì)
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