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文檔簡(jiǎn)介
1、2008年5月到8月,黃海中部爆發(fā)了大規(guī)模綠潮(滸苔),這是有報(bào)道以來(lái)世界上最大規(guī)模的綠潮爆發(fā),嚴(yán)重影響了海洋生態(tài)系統(tǒng)及人類(lèi)活動(dòng)。本文利用細(xì)菌16SrRNA基因克隆文庫(kù)分析技術(shù)研究了大規(guī)模綠潮爆發(fā)期及爆發(fā)后黃海表層海水中微生物群落的多樣性,旨在探索大規(guī)模綠潮爆發(fā)對(duì)表層海水中微生物群落的影響,并且為大規(guī)模綠潮爆發(fā)與表層海水中微生物群落之間的相互作用與關(guān)系的研究提供有益的線索。
本研究所使用的表層海水樣品通過(guò)“北斗”號(hào)開(kāi)放航次
2、分別于2008年7月和8月在黃海的四個(gè)站點(diǎn)分別采集獲得。每個(gè)站點(diǎn)采集約200L表層海水,使用0.22微米孔徑的微孔濾膜過(guò)濾收集菌體,-20℃保存,返回實(shí)驗(yàn)室后保存在-80℃。提取環(huán)境總DNA后用于進(jìn)行16S rRNA基因的PCR擴(kuò)增。共成功構(gòu)建8個(gè)16S rRNA基因克隆文庫(kù),選擇限制性酶切圖譜帶型不同的克隆子進(jìn)行測(cè)序及后續(xù)分析。
共獲得228條有效序列,對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行分析后發(fā)現(xiàn),表層海水中的微生物主要分布于變形菌門(mén)(α-
3、,β-,γ-)(Proteobacteria),擬桿菌門(mén)(Bacteroidetes),藍(lán)細(xì)菌門(mén)(Cyanobacteria),疣微菌門(mén)(Verrucomicrobia),放線菌門(mén)(Actinobacteria),浮霉菌門(mén)(Planctomycetes)等6個(gè)細(xì)菌門(mén),8個(gè)主要類(lèi)群,其中的優(yōu)勢(shì)類(lèi)群為α變形菌(33%),γ變形菌(25%),擬桿菌(23%)和藍(lán)細(xì)菌(9%)。除此之外,還有部分序列目前為止無(wú)法確定其系統(tǒng)發(fā)育地位。比較7月和8月
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