希金斯炭疽菌pitp生物信息學分析

1、希金斯炭疽菌 希金斯炭疽菌 PITP 生物信息學分析 生物信息學分析韓長志（西南林業(yè)大學林學院／云南省森林災害預警與控制重點實驗室，昆明６５０２２４）摘要：以釀酒酵母中已經(jīng)報道的５個典型ＰＩＴＰ序列為基礎，對炭疽菌屬蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫進行Ｂｌａｓｔｐ比對以及 關鍵詞 搜索，并通過ＳＭＡＲＴ保守結構域分析，明確該菌含有４個典型的ＰＩＴＰ；同時，通過對上述氨基酸序列進行疏水性、細胞信號肽、跨膜區(qū)結構域、亞細胞定位以及二級結構等生物信息學分析，并與

2、其他物種中１５個同源序列進行遺傳關系比較分析，以期為深入開展希金斯炭疽菌（Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｈｉｇｇｉｎｓａｎｕｍ Ｓａｃｃ． ）ＰＩＴＰ的功能研究打下理論基礎，同時，也為進一步開展其他炭疽菌的研究提供重要的理論指導。關鍵詞 ：希金斯炭疽菌（Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｈｉｇｇｉｎｓａｎｕｍ Ｓａｃｃ． ） ；磷脂酰肌醇轉(zhuǎn)移蛋白質(zhì)；生物信息學分析；遺傳關系；炭疽菌屬中圖分類號：Ｑ８１文獻標識碼：A 文章編號：0439－８

3、114（２０15）03－0７１３-0４希金斯炭疽菌（Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｈｉｇｇｉｎｓａｎｕｍ Ｓａｃｃ． ）屬于炭疽菌屬真菌，其可以侵染如百脈根、擬南芥以及棉花等，而對于真菌ＰＩＴＰ的研究報道較為少見。本研究以釀酒酵母（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ Ｓ２８８ｃ）中已經(jīng)報道的５個典型ＰＩＴＰ氨基酸序列為基礎，通過在炭疽菌屬蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中進行Ｂｌａｓｔｐ比對分析以及 關鍵詞 搜索，獲得與釀酒酵母ＰＩＴＰ同源

4、的Ｃ． ｈｉｇｇｉｎｓａｎｕｍ序列，并通過保守結構域分析、疏水性分析、二級結構預測等生物信息學分析，以期明確該菌中所存在的ＰＩＴＰ數(shù)量、疏水性特點、結構特征以及細胞定位情況，同時，基于上述ＰＩＴＰ氨基酸序列，在美國國家生物信息中心（ＮＣＢＩ）在線進行同源序列搜索，通過遺傳關系分析，以期為進一步開展其他炭疽菌中ＰＩＴＰ的研究提供理論指導。１材料與方法１．１材料根據(jù)釀酒酵母中含有的５個ＰＩＴＰ（Ｓｅｃ１４、Ｐｄｒ１６、Ｐｄｒ１７、Ｓｆｈ５