山羊GH基因部分序列多態(tài)及生物信息學分析.pdf

1、生長激素(growth hormone，GH)是一種種屬特異性激素，由垂體前葉分泌，為機體正常生長和泌乳所必需，在促進蛋白合成、調節(jié)糖和脂肪代謝過程中發(fā)揮著重要的作用。本試驗采用PCR-SSCP技術，將GH基因作為目的基因，對黃淮山羊、長江三角洲白山羊以及波爾山羊168只個體進行多態(tài)性檢測，分析山羊GH基因5′側翼區(qū)兩個位點以及第2和第3外顯子的遺傳多樣性，并分析了各多態(tài)位點與山羊體重性狀之間的關系，探討調控山羊生長發(fā)育的基因位點，為黃

2、淮山羊、長江三角洲白山羊的選育和保種提供理論基礎。在此基礎上，進一步利用生物信息學軟件對GH基因的氨基酸組成、蛋白理化性質、5′側翼序列的轉錄因子結合位點以及序列的特征進行了分析，并進行了結構和功能的預測。研究結果如下： 1、山羊GH基因部分序列的PCR-SSCP分析在四個擴增片段上均發(fā)現了突變，其中在第1對引物P1上出現6種基因型(AA，AB，BB，BC，CC，AC)；第2對引物P2上出現3種基因型(DD，DE，EE)；第3

3、對引物出現2種基因型(GG，GJ)；第4對引物出現6種基因型(MM，MN，NN，KK，MK，NK))。測序結果表明：第1個位點上存在2處突變，分別是60位C→T和211位C堿基的缺失；第2個位點上存在3處突變，分別是264位T→C，292位T→A，372位C→T；第2外顯子的782位發(fā)生了G→A的突變，并且該處突變導致了丙氨酸→蘇氨酸的改變；第3外顯子的存在兩處突變，分別是1116位A→G，1148位C→T，這兩處突變并未造成氨基酸的改

4、變，屬于無義突變。 2、GH基因群體遺傳學分析及與山羊生產性能的關系群體遺傳學分析表明：在第1個位點，黃淮山羊和長江三角洲白山羊均以AB型個體最多，B等位基因頻率最高，達到0.55左右；第2個位點，三個群體均以DD型個體最多，以等位基因D為主，基因頻率在0.75～0.91之間；外顯子2只出現GG、GJ兩種基因型，并未發(fā)現JJ型個體，其中GJ基因型個體在三個山羊群體中出現頻率最高，在0.716～0.909之間；外顯子3在三個群體

5、中均以MM型個體居多，黃淮山羊和長江三角洲白山羊都出現了MM、MN、KK、MK、NK等5種基因型個體，但是并未發(fā)現NN型個體；而波爾山羊則僅出現MM、MN、NN基因型個體，K等位基因未出現。群體平衡檢測發(fā)現，山羊GH基因P2擴增片段在三個品種中的x<'2>值都未達到顯著水平，處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P>0.05)，而外顯子2的擴增片段E2的x<'2>值則都達到顯著水平，三個群體在該位點的基因型分布極顯著偏離Hardy-

6、Weinberg平衡(P<0.01)，說明該位點有經過人工選擇的可能，此外，在P1位點，波爾山羊的基因型分布處于平衡狀態(tài)，而黃淮山羊和長江三角洲白山羊則都偏離平衡狀態(tài)，在E3位點，波爾山羊和長江三角洲白山羊處于平衡狀態(tài)，而黃淮山羊則偏離平衡狀態(tài)，估計原因是這兩個位點分別受到不同的選育方向或是遺傳進化環(huán)境不同造成的。各多態(tài)位點與體重性狀的最小二乘分析表明：啟動子區(qū)域第一個位點P1上黃淮山羊AA、CC基因型個體的出生重和周齡重均略高于BB型