茶基因數據庫的構建研究.pdf

1、茶含有多種對人體有益的化學成分，能夠防癌、降血脂、抗衰老等，茶已經是世界三大飲料（咖啡、茶、可可）之一，具有很大的經濟價值，對茶葉的深入研究很有必要。目前對茶樹基因組的測序已經有多個單位在進行，并且積累了大量的數據。從物種基因數據發(fā)展的歷史經驗看，隨著物種基因組測序計劃的展開，相應的基因數據庫和網站就會建立起來，但檢索和研究發(fā)現，世界上依然沒有專門的茶樹基因數據庫和網站，提供序列管理、分析服務。因此，茶樹基因數據庫的構建具有重要的現實意

2、義。本文對前期采樣測序所得數據及搜集的茶樹數據進行分析注釋整理，使用LAMP架構進行茶樹基因數據庫的開發(fā)，提供了茶樹基因及其注釋數據的下載、貴州古茶樹SSR位點查詢、茶樹基因數據可視化等功能。
　　本研究主要內容包括：⑴采集貴州古茶樹樣本，進行RNA提取及測序等；⑵對獲得的貴州古茶樹樣本數據，進行數據分析、整合、注釋等，對貴州古茶樹樣本進行SSR位點信息的分析；⑶收集整理NCBI數據庫中的茶樹基因資源；⑷構建茶基因數據庫。茶樹基因