高血壓相關(guān)基因生物數(shù)據(jù)庫平臺的構(gòu)建.pdf

1、高血壓是一種復(fù)雜的疾病，隨著高血壓疾病發(fā)病率的增加，高血壓以及高血壓的并發(fā)癥嚴(yán)重威脅人類的健康。因此提高人們對高血壓疾病的重視，對高血壓疾病的早預(yù)防、早治療起到關(guān)鍵的作用。
　　隨著生物學(xué)領(lǐng)域的不斷發(fā)展，生物數(shù)據(jù)的不斷增加，從而使大型數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)量不斷增長，增加了獲得數(shù)據(jù)難度。為了方便研究人員更快捷高效的獲得需要的數(shù)據(jù)，就要建立本地二級數(shù)據(jù)庫，然后將整合相關(guān)的數(shù)據(jù)存放到本地?cái)?shù)據(jù)庫里。通過對高血壓的數(shù)據(jù)與生物數(shù)據(jù)庫的認(rèn)識，關(guān)于高血壓

2、的相關(guān)生物數(shù)據(jù)庫也比較少，內(nèi)容也不夠完整，為了能使高血壓的數(shù)據(jù)庫不斷的更新與完善，將相關(guān)基因的數(shù)據(jù)存放到數(shù)據(jù)庫中，可以通過搜索得到高血壓的相關(guān)數(shù)據(jù)，所以設(shè)計(jì)高血壓相關(guān)基因的生物數(shù)據(jù)庫來存儲這些相關(guān)數(shù)據(jù)，通過高血壓數(shù)據(jù)庫的平臺，可以更好的獲得相關(guān)基因數(shù)據(jù)，從而對高血壓數(shù)據(jù)進(jìn)行的相關(guān)分析研究提供方便。
　　本文針對高血壓疾病的研究，建立了本地二級數(shù)據(jù)庫，高血壓相關(guān)數(shù)據(jù)主要來自于網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫NCBI和實(shí)驗(yàn)采集獲得的數(shù)據(jù)，根據(jù)高血壓相關(guān)基因

3、數(shù)據(jù)的屬性特征，設(shè)計(jì)數(shù)據(jù)庫模塊，主要分為基本生物信息庫和snp數(shù)據(jù)庫兩個模塊，為每個數(shù)據(jù)庫創(chuàng)建相關(guān)的數(shù)據(jù)表。高血壓相關(guān)基因的數(shù)據(jù)庫創(chuàng)建是在Linux操作系統(tǒng)下，搭建集成開發(fā)環(huán)境Xampp，該環(huán)境是Apache服務(wù)器，MySQL數(shù)據(jù)庫和PHP編程語言等的集成，基于CS技術(shù)上創(chuàng)建以MySQL為基礎(chǔ)的關(guān)系型數(shù)據(jù)庫，將相關(guān)數(shù)據(jù)導(dǎo)入到數(shù)據(jù)表中，通過用PHP等相關(guān)的編程語言來實(shí)現(xiàn)對數(shù)據(jù)庫的關(guān)鍵詞的檢索，而且該數(shù)據(jù)庫也整合了Blast的搜索方法進(jìn)行數(shù)

4、據(jù)的相關(guān)檢索，使創(chuàng)建的高血壓相關(guān)數(shù)據(jù)庫得到更好的應(yīng)用。BioLinux系統(tǒng)下搭建BioMart分析平臺，配置Java環(huán)境，Cytoscape、JBrowse等分析軟件的研究與應(yīng)用。對樣本采集數(shù)據(jù)進(jìn)行了基因篩選、基因確定的分析操作和高血壓相關(guān)數(shù)據(jù)的分析，對HIF1a基因序列用perl語言編程來實(shí)現(xiàn)genbank內(nèi)容的可視化，對相關(guān)的基因序列進(jìn)行序列比對來分析序列之間的相似性，通過對基因利用相關(guān)軟件以及一些方法來進(jìn)行分析，使我們對生物信息學(xué)