肝細(xì)胞癌轉(zhuǎn)移預(yù)測(cè)模型的建立及其轉(zhuǎn)移相關(guān)基因的篩選——cDNA微陣列技術(shù)分析.pdf

1、復(fù)旦大學(xué)博士學(xué)位論文肝細(xì)胞癌轉(zhuǎn)移預(yù)測(cè)模型的建立及其轉(zhuǎn)移相關(guān)基因的篩選——cDNA微陣列技術(shù)分析姓名：葉青海申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：博士專業(yè)：外科學(xué)指導(dǎo)教師：湯釗猷20020920復(fù)旦大學(xué)博士學(xué)位論文移相關(guān)的基因改變大部分在原發(fā)瘤階段就已經(jīng)發(fā)生。然后，采用BRB一陣列分析軟件中另一種先導(dǎo)的分析方法“混合共變預(yù)測(cè)法”(CompoundCovariatePredictorTool，CCP)，利用伴和不伴肝內(nèi)轉(zhuǎn)移的肝癌之間153個(gè)有顯著性差異的基因，我們

2、在國(guó)際上首次利用腫瘤的基因表型建立了一個(gè)肝癌轉(zhuǎn)移的預(yù)測(cè)模型，能在原發(fā)瘤階段就預(yù)測(cè)肝癌是否具有轉(zhuǎn)移傾向。這一預(yù)測(cè)模型除將建立模型的20例標(biāo)本完全正確(100％)歸類外，還準(zhǔn)確預(yù)測(cè)了20例待測(cè)標(biāo)本中的至少18例，預(yù)測(cè)準(zhǔn)確率達(dá)90％以上。為減少因顯著水平太高(p0001)而引起的假陰性結(jié)果，我們?cè)俅尾捎肂RB一陣列分析軟件中的分類比較法，在pO002水平尋找伴與不伴肝內(nèi)轉(zhuǎn)移的肝癌之間表達(dá)有差異的基因，結(jié)果發(fā)現(xiàn)了224個(gè)基因表達(dá)有顯著性差異，從

3、中篩選出36個(gè)在兩組間表達(dá)差異更加明顯的基因。發(fā)現(xiàn)其中一個(gè)基因骨橋蛋白(Osteopontin，OPN)在伴肝內(nèi)轉(zhuǎn)移的肝癌中高表達(dá)(超過無瘤肝組織3倍)，而在無轉(zhuǎn)移肝癌中變化不明顯。然后，進(jìn)一步利用幾個(gè)具有不同轉(zhuǎn)移潛能的肝癌細(xì)胞系對(duì)其進(jìn)行了功能鑒定，體外細(xì)胞侵襲實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)抗骨橋蛋白中和抗體能顯著抑制肝癌高轉(zhuǎn)移細(xì)胞如SKHep1及MHCC97等的侵襲能力，證實(shí)骨橋蛋白為一與肝癌轉(zhuǎn)移密切相關(guān)的基因。半定量RT。PCR和免疫組織化學(xué)實(shí)驗(yàn)也進(jìn)一步