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文檔簡(jiǎn)介
1、在系統(tǒng)生物中,學(xué)習(xí)和模擬基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)是一個(gè)非常重要的課題.而在1979年,Kauffman第一次提出用布爾網(wǎng)絡(luò)模擬基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò).布爾網(wǎng)絡(luò)能夠根據(jù)其實(shí)際環(huán)境,從不同的角度出發(fā),抽象為相互作用的節(jié)點(diǎn).到目前為止,對(duì)布爾網(wǎng)絡(luò)的理論研究已經(jīng)取得了很大的結(jié)果,對(duì)探索生命活動(dòng)的機(jī)理和疾病治療發(fā)揮了巨大的作用.在布爾網(wǎng)絡(luò)中,每個(gè)基因在離散時(shí)間t=0,1,2,…的表達(dá)被賦予兩種狀態(tài):表達(dá)(1)或者不表達(dá)(0),每一個(gè)在t+1時(shí)刻的狀態(tài)變量由與之相鄰在t
2、時(shí)刻的狀態(tài)變量所決定.因此布爾網(wǎng)絡(luò)是一個(gè)離散的邏輯系統(tǒng).而研究這類(lèi)系統(tǒng)的數(shù)學(xué)工作相對(duì)缺乏,本文利用半張量積這個(gè)工具,將離散的邏輯系統(tǒng)轉(zhuǎn)化為普通的離散動(dòng)態(tài)系統(tǒng),因此可以將很多已有的控制理論的知識(shí)運(yùn)用到布爾網(wǎng)絡(luò)中.論文的主要內(nèi)容及創(chuàng)新點(diǎn)如下:
第一章作為預(yù)備知識(shí),介紹了半張量積的定義和性質(zhì),邏輯函數(shù)的矩陣表示和布爾網(wǎng)絡(luò)的代數(shù)表達(dá)式.
第二章研究了布爾網(wǎng)絡(luò)的干擾解耦問(wèn)題.首先證明了一般的牽制控制點(diǎn)選擇方法:任意選擇牽制控制
3、點(diǎn)和基于度選擇控制點(diǎn)在處理布爾網(wǎng)絡(luò)的干擾解耦問(wèn)題是不可行的.基于此我們提出了一種新的方法基于秩條件的牽制控制點(diǎn)選擇算法,設(shè)計(jì)了基于秩條件的牽制狀態(tài)反饋控制器和輸出反饋控制器,并且給出了控制器的個(gè)數(shù)范圍.然后把結(jié)果應(yīng)用到細(xì)胞凋亡網(wǎng)絡(luò)中.另一方面,我們?cè)O(shè)計(jì)了事件驅(qū)動(dòng)干擾解耦控制器.基于冗余變量分離方法,找到驅(qū)動(dòng)條件并且提出了兩個(gè)有效的算法設(shè)計(jì)事件驅(qū)動(dòng)控制器.最后我們分析動(dòng)態(tài)-代數(shù)布爾網(wǎng)絡(luò)的干擾解耦問(wèn)題,設(shè)計(jì)出了所有的狀態(tài)反饋控制器和輸出反饋
4、控制器.在此基礎(chǔ)上我們分析了當(dāng)函數(shù)發(fā)生攝動(dòng)時(shí),控制器的魯棒性問(wèn)題,并且把結(jié)果應(yīng)用到大腸桿菌乳糖操縱子模型中.
第三章研究了布爾網(wǎng)絡(luò)的魯棒輸出控制不變集.一方面假設(shè)對(duì)任意給定的集合和控制器,得到一個(gè)充要條件判斷給定的集合是否為魯棒輸出控制不變集.另一方面對(duì)給定的集合,設(shè)計(jì)輸出反饋控制器使得該集合是魯棒控制不變集.
第四章研究了動(dòng)態(tài)-代數(shù)布爾網(wǎng)絡(luò)的函數(shù)攝動(dòng)對(duì)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)的影響。首先我們討論了在函數(shù)攝動(dòng)下,動(dòng)態(tài)-代數(shù)布爾網(wǎng)絡(luò)的
5、狀態(tài)轉(zhuǎn)移矩陣如何變化.然后在保證局部解唯一的前提下分析了當(dāng)函數(shù)攝動(dòng)分別發(fā)生在靜態(tài)方程和動(dòng)態(tài)方程時(shí),拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)的變化.
第五章研究了動(dòng)態(tài)-代數(shù)布爾網(wǎng)絡(luò)的標(biāo)準(zhǔn)化問(wèn)題.首次提出了動(dòng)態(tài)-代數(shù)布爾網(wǎng)絡(luò)新的代數(shù)表達(dá)式,基于此我們研究了動(dòng)態(tài)-代數(shù)布爾網(wǎng)絡(luò)的標(biāo)準(zhǔn)化問(wèn)題,弱化了標(biāo)準(zhǔn)化條件.在此基礎(chǔ)上研究動(dòng)態(tài)-代數(shù)布爾網(wǎng)絡(luò)的可解性和解唯一性問(wèn)題.
第六章研究了動(dòng)態(tài)-代數(shù)布爾網(wǎng)絡(luò)的可控性問(wèn)題.基于第五章得到的標(biāo)準(zhǔn)化條件,我們定義了更低維數(shù)的
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