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文檔簡(jiǎn)介
1、本研究采用親緣生物法的生物信息學(xué)技術(shù),獲得(魚(yú)屯)魚(yú)rRNA重復(fù)基因家族全序列,根據(jù)該序列設(shè)計(jì)3對(duì)引物(P1/P2、P3/P4和P5/P6),以鱖魚(yú)基因組DNA為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,將擴(kuò)增產(chǎn)物克隆到pUCm-T質(zhì)粒,測(cè)序.結(jié)果表明:鱖魚(yú)的3個(gè)rRNA基因克隆片段的核苷酸序列全長(zhǎng)分別為3,321bp、2,873bp和1,502bp,將3個(gè)鱖魚(yú)rRNA基因片段拼接成整個(gè)rRNA重復(fù)基因家族,序列全長(zhǎng)為7,139bp,其中18S、ITS1、
2、5.8S、ITS2和28S基因的大小分別為1,837bp、745bp、158bp、434bp和3,073bp.序列已提交給美國(guó)NCBI的GenBank,接受登記編號(hào)分別為AY452489、AY452490、AY452491、AY452492、AY452493、AY452494、AY452495.同時(shí),將鱖魚(yú)rRNA重復(fù)基因家族序列與人、挪威鼠、鮑魚(yú)、羅非魚(yú)、鏡鯉和虹鱒之間的序列分別進(jìn)行同源性與進(jìn)化關(guān)系分析,發(fā)現(xiàn)18S、5.8S、28S、
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