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文檔簡介
1、第一部分P53敲除A375細胞系的建立
目的:利用CRISPR/CAS9系統(tǒng)建立p53敲除的細胞系
方法:設計兩條針對人的p53基因的gRNA,分別將兩條 gRNA插入pBT-U6-Cas9-2A-GFP表達質粒,然后將含有不同 gRNA的質粒分別轉染進入 K562細胞,用SUVEYOR突變檢測試劑盒,對兩條設計的gRNA的剪切效率進行比較,選取效率較高gRNA進行后續(xù)p53敲除。在A375細胞中轉染GFP標記含有g
2、RNA和CAS9核酸酶的質粒,驗證突變,同時流式分選出GFP陽性的細胞。將分選出的細胞,分別單個接種于96孔板,待其克隆形成。部分克隆形成之后,將其擴增傳代,形成單克隆細胞系。為從中篩選出p53敲除細胞,首先我們使用x-ray處理所有獲得克隆,然后免疫電泳檢測所有克隆中p53的表達情況,選出p53表達陰性的克隆進行測序,以驗證p53敲除的可靠性。同時也對X射線刺激細胞,然后對p53下游基因p21進行檢測,以在功能上確認p53的敲除。
3、r> 結果:SUVEYOR結果顯示設計的兩條gRNA均可以造成突變,編輯效率第一條gRNA較好。使用gRNA1轉染A375細胞,SUVEYOR檢測到突變發(fā)生。Western檢測p53在各個克隆中的表達發(fā)現(xiàn),在獲得的23個克隆中,有3個克隆在p53位置出現(xiàn)了缺失,敲除效率為3/23.同時使用PCR對敲除位點進行了擴增,相比正常WT p53條帶,所獲得疑似敲除克隆的p53條帶位置均發(fā)生了變化。測序結果顯示,所獲得三個陽性克隆p53基因段均
4、發(fā)生了明顯的基因插入或者缺失,導致了p53表達的失調。最后對p53下游基因p21的表達進行檢測,發(fā)現(xiàn)所獲克隆中,在p53已被激活的情況下,p21的表達全部缺失。
結論:利用CRISPR/CAS9系統(tǒng),成功敲除p53基因,獲得了穩(wěn)定遺傳的p53完全敲除和p53變異細胞株。
第二部分 p53通過microRNAs抑制B7-H1的表達
目的:研究p53敲除后是否對細胞B7-H1的表達造成影響以及通過何種機制影響其
5、表達
方法:分別用流式檢測A375,HCT116和其p53敲除前后的B7-H1表達;使用RT-PCR檢測 B7-H1的信使 RNA在 A375,HCT116和其 p53敲除細胞系中的表達;使用microRNA芯片檢測A375和A375Δp53細胞之間的microRNA表達差異,并結合B7-H1靶點預測,從而篩選出可能具有對B7-H1具有調控功能的microRNAs;將篩選出來的microRNAs mimics轉染A375Δp5
6、3細胞,觀察B7-H1在各個不同mimics轉染后的表達情況,選擇出調控B7-H1表達的microRNA;使用特異性inhibitors同mimics一同轉染A375Δp53細胞,以確認microRNA作用的特異性;使用qRT-PCR檢測A375,HCT116和其 p53敲除前后以及使用 siRNA敲除 p53之后的microRNA-34a以及microRNA-200b表達,以驗證p53對microRNA-34a以及microRNA-2
7、00b表達的調控作用,并使用免疫電泳對p53以及B7-H1的表達進行檢測。構建雙熒光報告載體驗證microRNA-34a以及microRNA-200b靶向作用于B7-H1的3UTR。
結果:當p53缺失時,通過流式檢測發(fā)現(xiàn)B7-H1的表達在A375,HCT116細胞中均明顯上升;之后,對B7-H1的信使RNA表達水平進行檢測,發(fā)現(xiàn)p53的敲除,并不影響B(tài)7-H1 mRNA的表達,結果無顯著性差異;通過篩選,并結合靶向預測,我們
8、發(fā)現(xiàn)在p53敲除前后,有8個候選microRNAs可能調控B7-H1表達。轉染mimics后發(fā)現(xiàn),microRNA-34a和microRNA-200b可下調B7-H1在A375Δp53細胞中的表達,差異明顯。在加入microRNA-34a和microRNA-200b inhibitors共轉染時,這種下調效果可被消除。實時定量PCR檢測發(fā)現(xiàn),在p53敲除或敲低的情況下,microRNA-34a和microRNA-200b表達明顯下降,同
9、時B7-H1的表達上調。雙熒光素報告載體檢測發(fā)現(xiàn),microRNA-34a和microRNA-200b可特異性結合域B7-H1的3’UTR端調控轉錄。
結論:p53的敲除下調 microRNA-34a和 microRNA-200b的表達,從而抑制microRNA-34a和microRNA-200b對B7-H1信使RNA的作用,導致B7-H1蛋白表達上升。
第三部分 microRNA-34a和microRNA-200b
10、調控Jurkat增殖和細胞因子分泌
目的:研究microRNA-34a和 microRNA-200b通過調控 B7-H1分子從而影響 Jurkat細胞的功能,介導免疫抑制。
方法:培養(yǎng)Jurkat細胞,用TPA刺激,誘導其表達PD-1受體,免疫電泳檢測誘導表達效果;將誘導表達PD-1的Jurkat細胞同A375Δp53細胞共培養(yǎng),利用B7-H1阻斷性抗體抑制 B7-H1/PD-1通路的激活,觀察 Jurkat細胞的增
11、殖情況。在使用microRNA-34a和microRNA-200b的mimics和inhibitors分別轉染A375Δp53細胞后同Jurkat細胞共培養(yǎng),以觀察microRNA-34a和microRNA-200b對細胞造成的增殖改變。同時收集共培養(yǎng)細胞的上清培養(yǎng)液,檢測microRNA-34a和microRNA-200b對細胞分泌IFN-gamma,IL-2細胞因子的影響。
結果:jurkat細胞在 TPA刺激后,其 PD
12、-1的表達明顯增強。將刺激后的細胞同A375Δp53細胞共培養(yǎng),其增殖受到明顯抑制,在用B7-H1抗體阻斷后,此種增值抑制效應可以得到解除;同時,結果顯示,A375Δp53細胞相對于A375細胞更能明顯抑制Jurkat細胞增殖。在A375Δp53細胞中轉染進microRNA-34a和microRNA-200b的mimics后可以部分消除對Jurkat細胞的增殖抑制效應,加入對應inhibitors,可以恢復對Jurkat細胞的抑制。同時
13、對細胞因子的檢測發(fā)現(xiàn),A375Δp53細胞表達B7-H1抑制Jurkat細胞的細胞因子分泌,microRNA-34a和microRNA-200b的mimics轉染可以有效解除抑制效果,共轉染對應inhibitors可以使得分泌再次被抑制。
結論:PD-1/B7-H1通路的激活可以抑制Jurkat細胞的增殖。A375Δp53細胞相比A375細胞具有更強的免疫抑制能力,此種抑制效應同microRNA-34a和microRNA-20
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