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1、【實(shí)驗(yàn)原理】聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)是模擬體內(nèi)DNA復(fù)制條件在體外酶促合成特異DNA片段的循環(huán)反應(yīng),可使目的DNA片段得以迅速擴(kuò)增。其主要步驟是:將待擴(kuò)增的模板DNA置于高溫(約93℃95℃)下使之變性解鏈;人工合成的兩個(gè)寡核苷酸引物在低溫(約50℃70℃)下分別與目的DNA片段兩側(cè)的互補(bǔ)序列復(fù)性結(jié)合;引物在DNA聚合酶作用(約70℃75℃)下沿模板按5’→3’方向延伸,合成目的DNA片段的新互補(bǔ)鏈。如此經(jīng)過(guò)n個(gè)周期,理論上擴(kuò)增2n倍一
2、般PCR經(jīng)3040周期后可獲得百萬(wàn)倍以上的目的DNA。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)—限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)(PCR—RFLP)分析技術(shù)是在PCR技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來(lái)的。DNA堿基置換正好發(fā)生在某種限制性內(nèi)切酶識(shí)別位點(diǎn)上,使酶切位點(diǎn)增加或者消失,利用這一酶切性質(zhì)的改變,PCR特異擴(kuò)增包含堿基置換的這段DNA,經(jīng)某一限制酶切割,再利用瓊脂糖凝膠電泳分離酶切產(chǎn)物,與正常比較來(lái)確定是否變異。應(yīng)用PCR—RFLP,可檢測(cè)某一致病基因已知的點(diǎn)突變,進(jìn)行直接基因診斷,也
3、可以此為遺傳標(biāo)記進(jìn)行連鎖分析進(jìn)行間接基因診斷。本實(shí)驗(yàn)以家族性甲型血友病患者及其相關(guān)成員外周血DNA為模板,PCR擴(kuò)增凝血因子FⅧ基因的583bp特異片段產(chǎn)物,其中包含MspⅠRFLP多態(tài)位點(diǎn),經(jīng)MspⅠ酶切后,瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)等位片段的長(zhǎng)度(583bp或360bp223bp),以此為遺傳標(biāo)記進(jìn)行連鎖分析,判斷胎兒是否得到了帶有缺陷FⅧ基因的染色體,從而做出間接基因診斷。【實(shí)驗(yàn)用品】1DNA(50ngμl)、引物Ⅰ和Ⅱ(20μΜ)、Ta
4、qDNA聚合酶(5Uμl)10PCR反應(yīng)緩沖液、dNTP(2.5mM)、滅菌蒸餾水、液體石蠟、限制性內(nèi)切酶MspⅠ(20Uμl)、10酶切緩沖液。22%的瓊脂糖凝膠、5TAE、6上樣緩沖液、DNAMarker、溴化乙啶貯存液(10mgml)(EB)。3PCR自動(dòng)熱循環(huán)儀、紫外透射儀、微量加樣器(20μl、200μl)、槍頭(20μl、200μl)及離心管(1ml、0.5ml)、容器盒、恒溫水浴箱、瓊脂糖凝膠電泳裝置、燒杯、保鮮膜、封口膜
5、、浮漂、微波爐、250ml三角燒瓶、透明膠帶、托盤(pán)天平、臺(tái)式高速離心機(jī)?!緦?shí)驗(yàn)步驟】一PCR反應(yīng)PCR反應(yīng)體系20μl,其成分如下:按以上次序,將各物質(zhì)加入到一只無(wú)菌的0.5ml離心管中。輕輕混勻后,離心5秒鐘,加入一滴液體石蠟蓋于反應(yīng)混合液的表面,然后放入PCR儀中進(jìn)行循環(huán)反應(yīng)。PCR反應(yīng)循環(huán)溫度:94℃預(yù)變性3分鐘,然后進(jìn)行以下循環(huán)30次最后經(jīng)72℃再充分延伸7分鐘。反應(yīng)結(jié)束后置4℃冰箱保存。二PCR產(chǎn)物的MspⅠ酶切反應(yīng)體系20μ
6、l其成分如下:置37℃水浴消化1小時(shí),4℃保存。三瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)1膠板的準(zhǔn)備取有機(jī)玻璃內(nèi)槽,洗凈晾干。取透明膠帶將有機(jī)玻璃內(nèi)槽的兩端邊緣封好(注意,將透明膠帶緊貼于有機(jī)玻璃內(nèi)槽的兩端邊上,不要留空隙)。將有機(jī)玻璃內(nèi)槽置于一水平位置,在距離底板0.5~1.0ml的位置放入梳子。22%的瓊脂糖凝膠的制備稱(chēng)取1克瓊脂糖,置于錐形瓶?jī)?nèi),加入50ml1TAE,瓶口用保鮮膜封蓋,在微波爐中加熱直至瓊脂糖全部溶解,得到2%瓊脂糖凝膠液,待其冷卻至
7、65℃左右,加入2.5μl溴化乙啶貯存液(10mgml),使溴化乙啶終濃度為0.5μgml。小心混勻并倒在有機(jī)玻璃內(nèi)槽中,控制灌膠速度,使膠液緩慢展開(kāi),避免產(chǎn)生氣泡,直到在整個(gè)有機(jī)玻璃板表面形成均勻的膠層。室溫下靜置1小時(shí)左右,待膠凝固完全后,輕輕拔出梳子,在膠板上即形成相互隔開(kāi)的樣品槽。3將凝膠放入電泳槽中,加入恰好沒(méi)過(guò)膠面1mm深的足夠電泳緩沖液,預(yù)電泳10min。4每份限制酶切產(chǎn)物取10μl,加2μl6上樣緩沖液,混勻后加入到樣品
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