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文檔簡介
1、三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)光合效率高,繁殖周期短,脂肪酸含量較高,使其具有生產(chǎn)生物柴油的潛力。三角褐指藻目前已完成全基因組測序,高效的基因槍、電穿孔轉(zhuǎn)化體系也已成功構(gòu)建,可實(shí)現(xiàn)RNA介導(dǎo)的基因沉默,使其成為一個更具吸引力的探索基因功能的模型系統(tǒng)。β-1,3葡聚糖(金藻昆布多糖)是三角褐指藻的主要儲存多糖,其合成底物尿苷二磷酸葡萄糖(UDPG),由尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UDP-glucose p
2、yrophosphorylase,UGPase)催化可逆反應(yīng)UTP+G-1-P←→UDPG+PPi生成。馬鈴薯(Solanumtuberosum L)、甘蔗(Saccharum officinarum)、擬南芥(Arabidopsis thaliana)等高等植物UGPase的研究表明,UGPase是碳水化合物代謝途徑中的關(guān)鍵酶,并在碳流的分配過程中起著至關(guān)重要的作用。為了闡明三角褐指藻UGPase的功能及其對碳流分配的影響,本實(shí)驗(yàn)主要
3、包括兩部分內(nèi)容:
第一部分,根據(jù)已有文獻(xiàn)報道,選取不同的磷濃度和溫度對三角褐指藻進(jìn)行處理,實(shí)驗(yàn)分別設(shè)定5個磷梯度和4個溫度梯度,將三角褐指藻培養(yǎng)至指數(shù)生長末期;然后采用實(shí)時定量PCR(QRT-PCR)技術(shù)分析UGPase基因(UGP)的轉(zhuǎn)錄水平,測定UGPase的酶活和金藻昆布多糖的含量。初步確定三角褐指藻UGP受磷濃度和溫度調(diào)控的表達(dá)模式。
第二部分,首先依據(jù)三角褐指藻的全基因組測序結(jié)果,對UGP進(jìn)行初步的信息學(xué)分
4、析。根據(jù)UGP的信息學(xué)分析結(jié)果,以遺傳轉(zhuǎn)化載體pha-T1為骨架,構(gòu)建反向重復(fù)干擾載體(pUGP-IR)和反義干擾載體(pUGP-AS516,pUGP-AS237)。將這些干擾結(jié)構(gòu)用基因槍分別轉(zhuǎn)入三角褐指藻的基因組。然后我們先用博來霉素(Zeocin)初步篩選出陽性克隆,再用PCR技術(shù)檢測抗性基因ble。在此基礎(chǔ)上,我們進(jìn)一步采用LAPCR技術(shù)對干擾載體的整合位點(diǎn)進(jìn)行定位。最后我們對轉(zhuǎn)基因藻株進(jìn)行進(jìn)一步的研究,分別測定它們的生長曲線和比
5、生長速率,通過QRT-PCR對UGP的轉(zhuǎn)錄水平進(jìn)行分析,測定UGPase的酶活,金藻昆布多糖的含量,總脂的合成量等指標(biāo)。初步確定三角褐指藻UGPase的功能及其在碳流分配中的作用。
第一部分實(shí)驗(yàn)的研究結(jié)果表明:隨著磷濃度的升高,三角褐指藻內(nèi)UGP的轉(zhuǎn)錄水平上調(diào),UGPase的活性升高,同時檢測到金藻昆布多糖的含量增加。無磷組的藻株,金藻昆布多糖的含量僅占細(xì)胞干重的5%,比對照組降低了57%,對應(yīng)的UGP的轉(zhuǎn)錄水平下調(diào)了51%,
6、UGPase酶活也降低了3倍;隨著溫度的逐漸降低,藻細(xì)胞內(nèi)UGP轉(zhuǎn)錄水平上調(diào),UGPase的活性降低,金藻昆布多糖的合成量減少。10℃組藻細(xì)胞金藻昆布多糖的合成量最高(16.7%),比對照組(12%)增加了35%,對應(yīng)的對應(yīng)的UGP的轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)了21%,UGPase酶活也增加了35%。本研究表明磷對三角褐指藻UGPase起著正調(diào)控作用,溫度對三角褐指藻UGPase起著負(fù)調(diào)控作用。此外我們推測UGPase可能是金藻昆布多糖合成途徑的關(guān)鍵
7、酶。
第二部分實(shí)驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn):當(dāng)轉(zhuǎn)基因藻株的UGP轉(zhuǎn)錄豐度較野生型三角褐指藻下調(diào)4.89倍時,伴隨著UGPase的活性下降69%,對應(yīng)的金藻昆布多糖含量也降低了54.79%,僅占細(xì)胞干重的5%,總脂的合成量卻增加了15%。本研究通過RNA干擾技術(shù)手段使三角褐指藻UGPase失活,導(dǎo)致金藻昆布多糖的含量顯著降低,使得更多的總脂積累。這些結(jié)果表明,三角褐指藻的UGPase是金藻昆布多糖合成途徑的限速酶,在金藻昆布多糖和脂質(zhì)的生物合成
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