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1、基于質(zhì)譜技術(shù)的多肽組學(xué)可以用來(lái)研究生物體內(nèi)的小分子多肽。多肽組學(xué)方法在發(fā)現(xiàn)生物標(biāo)志物、蛋白酶和肽酶底物及調(diào)控蛋白水解過(guò)程中具有重要意義。
細(xì)胞凋亡是由基因調(diào)控的高度有序的細(xì)胞程序性死亡過(guò)程,對(duì)多細(xì)胞生物的發(fā)育和維持自身平衡至關(guān)重要?;钚匝跏羌?xì)胞凋亡的重要調(diào)控者,但其誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡的信號(hào)通路尚未完全闡述。迄今為止,Yca1p是酵母中發(fā)現(xiàn)的唯一類似哺乳動(dòng)物caspase蛋白的同源物。YCA1在調(diào)控酵母細(xì)胞凋亡中具有的重要作用已經(jīng)被證
2、實(shí),但其分子機(jī)制還有待進(jìn)一步研究。
為了進(jìn)一步研究活性氧(ROS)和YCA1在細(xì)胞凋亡中的機(jī)理,本實(shí)驗(yàn)以野生型釀酒酵母BY4741和突變株△yca1為實(shí)驗(yàn)材料,選用過(guò)氧化氫(H2O2)作為氧化壓力,用不同濃度H2O2分別處理野生型釀酒酵母細(xì)胞BY4741和突變株△yca1,菌落計(jì)數(shù)法和AnnexinⅤ/PI雙染法分別檢測(cè)酵母的存活率和凋亡率,并采用定量多肽組學(xué)的方法檢測(cè)凋亡過(guò)程中細(xì)胞內(nèi)多肽的變化,以期發(fā)現(xiàn)YCA1在凋亡過(guò)程中的
3、分子機(jī)制。實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下:
1.菌落計(jì)數(shù)法和AnnexinⅤ-FITC/PI雙染法檢測(cè)結(jié)果顯示,當(dāng)用不同濃度的過(guò)氧化氫處理野生型釀酒酵母BY4741和突變株△yca1時(shí),隨著濃度的增加,存活率均不斷地下降,凋亡率均不斷地增加。且野生型BY4741存活率均低于突變株△yca1,凋亡率均高于突變株△yca1。
2.用2mM H2O2處理野生型BY4741,檢測(cè)到912條多肽,有262條肽發(fā)生顯著變化,歸屬于121個(gè)蛋白前體
4、。檢測(cè)到的差異表達(dá)肽有48%位于前體蛋白的N或C端。有5種前體蛋白能夠產(chǎn)生6條以上的肽,分別是甘油醛-3-磷酸脫氫酶3、磷酸甘油酸激酶、果糖-二磷酸醛縮酶、60S酸性核糖體蛋白P1-α、熱休克蛋白60。來(lái)自于這5種蛋白產(chǎn)生的肽既有上調(diào)的,也有下調(diào)的。
3.用2mM H2O2處理突變株△yca1,總共鑒定出490條多肽,有170條肽發(fā)生顯著變化,歸屬于87個(gè)蛋白前體。其中兩條上調(diào)的肽gQDDLGkGDTEES、tPGAATIkP
5、TVE分別來(lái)自于超氧化物歧化酶[Cu-Zn]、過(guò)氧化物酶TSA1。50%差異表達(dá)肽位于前體蛋白的N或C端。絕大多數(shù)的肽來(lái)源于未表征的蛋白質(zhì)YNL208W、磷酸甘油酸激酶、延伸因子1-α、輔助伴侶蛋白SBA-1。
4.通過(guò)比較2mM H2O2處理野生型釀酒酵母BY4741和突變株△yca1后的多肽,發(fā)現(xiàn)有300條相同的肽,有182條肽發(fā)生變化,其中在兩種菌株均發(fā)生變化的有42條肽,只在在野生型BY4741發(fā)生顯著變化的有45條肽
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