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文檔簡介
1、自然界中的微生物與人類的生活息息相關(guān)。無論是歷史悠久的食醋、醬油、酒精飲料的釀造,還是現(xiàn)代工業(yè)中的微生物采礦、環(huán)境治理等都與微生物有著緊密的關(guān)系??茖W(xué)技術(shù)及醫(yī)療診斷的發(fā)展使人們認識到,人體內(nèi)的微生物與個體健康也有著千絲萬縷的聯(lián)系,人體微生態(tài)如口腔微生態(tài)、腸道微生態(tài)的失衡可能導(dǎo)致一系列疾病的發(fā)生和發(fā)展。人體微生物的群落結(jié)構(gòu)又受到生活環(huán)境與生活習(xí)慣的影響。
生物信息學(xué)分析軟件QIIME(Quantitative Insights
2、Into Microbial Ecology)和實時熒光定量核酸擴增檢測系統(tǒng)(RT-PCR)是比較成熟的研究微生物群落的工具和方法。本實驗基于QIIME和RT-PCR分別對口腔微生物和腸道益生菌做了不同方面的研究,旨在探索飲食習(xí)慣與口腔微生物群落結(jié)構(gòu)的關(guān)系,了解飲食習(xí)慣對人體健康的潛在影響,以及探索腸道益生菌共培養(yǎng)生長的生長特性的研究方法,為之后將共培養(yǎng)范圍擴展至全腸道微生物,模擬體內(nèi)環(huán)境進行益生菌互作或腸道微生物互作研究打下基礎(chǔ)。主要
3、內(nèi)容如下:
1、通過問卷調(diào)查,以大學(xué)生群體為研究對象,選取符合實驗要求的36名受試者提供唾液樣本。提取唾液樣本中微生物DNA并用Illumina測序平臺測序。使用Linux服務(wù)器搭建QIIME分析平臺,配置分析環(huán)境,使用QIIME軟件對測序數(shù)據(jù)進行一系列生物信息學(xué)分析。36名受試者分為葷食組(A組)19人,素食組(B組)17人。
在經(jīng)過生物信息學(xué)分析后,得出結(jié)論:口腔唾液中Corynebacterium、Strept
4、ococcus等潛在致病或條件致病菌的屬與常吃葷食呈正相關(guān),而Peptostreptococcus、Eubacterium等無害菌屬與常吃葷食呈負相關(guān)。實驗證明葷素飲食習(xí)慣與口腔微生物群落結(jié)構(gòu)存在關(guān)聯(lián)。
2、篩選出鼠李糖乳桿菌GG株(Lactobacillus rhamnosus GG,LGG)、動物雙歧桿菌第12號菌株(Bifidobacterium animalis subsp.Lactis Bb-12,BB12)、尼氏大
5、腸桿菌1917菌株(Escherichia coli Nissle1917)共3株益生菌參與益生菌共培養(yǎng)實驗,通過對生長標準曲線、生長動力學(xué)曲線的分析,確立共培養(yǎng)條件、設(shè)計共培養(yǎng)方案,使用麥康凱培養(yǎng)基對共培養(yǎng)體系中Nissle1917進行篩選培養(yǎng);以LGG的pheS基因為內(nèi)參基因,luxS基因為實驗基因進行RT-PCR實驗。
通過對Nissle1917菌株的共培養(yǎng)篩選實驗與LGG菌株的共培養(yǎng)RT-PCR實驗,得出結(jié)論:在共培養(yǎng)
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