石榴皮對(duì)非酒精性脂肪肝病的基因表達(dá)調(diào)控?cái)?shù)據(jù)分析.pdf

1、非酒精性脂肪肝病(Non-alcohol Fatty Liver Disease，NAFLD)是指除酒精和其他明確的損肝因素所致的肝細(xì)胞內(nèi)脂肪過度蓄積為主要特征的臨床病理綜合征?！岸未驌簟奔僬f中胰島素抵抗(Insulin resistance，IR)、氧化應(yīng)激和脂質(zhì)過氧化是當(dāng)前公認(rèn)的NAFLD發(fā)病的關(guān)鍵因素。近年來，對(duì)NAFLD發(fā)病機(jī)制的研究很多，但是NAFLD具體的發(fā)病機(jī)制尚未明確。因此，對(duì)NAFLD發(fā)病機(jī)制的深入研究有利于更先進(jìn)的

2、診斷及治療方法的發(fā)展。最近有研究發(fā)現(xiàn)石榴皮具有抗氧化、抑菌、抑制脂肪酸合成酶、調(diào)控肝細(xì)胞膽固醇的平衡和降血脂等效果。這些研究提示，石榴皮對(duì)NAFLD可能存在一定的治療效果。深入探討其對(duì)NAFLD影響的分子機(jī)制，可能幫助闡明其作用機(jī)制，為進(jìn)一步研究提供參考。
　　本文首先從NCBI中的GEO數(shù)據(jù)庫中下載基因芯片數(shù)據(jù)集GSE66316。利用Qlucore Omics Explorer3.0(QOE3.0)軟件分析篩選“高脂飲食和石榴皮

3、飼養(yǎng)8周”和“高脂飲食飼養(yǎng)8周”基因芯片數(shù)據(jù)中的差異表達(dá)基因。然后，應(yīng)用Database for Annotation,Visualization and Integrated Discovery(DAVID)對(duì)QOE3.0篩選出來的差異表達(dá)基因進(jìn)行基因功能富集分析。最后，利用Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins(STRING)在線分析軟件，建立基因編碼蛋

4、白關(guān)系網(wǎng)絡(luò)圖。通過分析，最終確定石榴皮對(duì)NAFLD的基因表達(dá)調(diào)控主要集中在一系列差異表達(dá)基因;再進(jìn)行文獻(xiàn)挖掘分析，發(fā)現(xiàn)石榴皮可能通過對(duì)幾個(gè)關(guān)鍵差異表達(dá)基因影響調(diào)節(jié)NAFLD的發(fā)生發(fā)展。
　　QOE3.0軟件分析篩選出172個(gè)差異表達(dá)基因。其中高表達(dá)基因118個(gè)，包括AAGAB、CAD、EXOC1、RPL10、TFB2M、RPS7、NHP2、TRUB1等;低表達(dá)基因54個(gè)，包括ISG15、OASL、NR3C1、AZGP1、BIRC5

5、、RGMA等。DAVID分析發(fā)現(xiàn)這172個(gè)差異表達(dá)基因主要涉及RNA結(jié)合、修飾與加工，核糖體及其復(fù)合物的生物合成，蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn)和定位，翻譯，一碳單位代謝，甲基化，GTPase的結(jié)合與活性結(jié)合，鈣離子結(jié)合，多糖結(jié)合，核苷三磷酸酶活性調(diào)節(jié)，轉(zhuǎn)錄輔激活因子的活性，轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合，核糖核蛋白復(fù)合體，線粒體，脂蛋白生物功能等生物過程、分子功能和細(xì)胞組分。將172個(gè)差異基因?qū)隨TRING中，最終篩選出13個(gè)差異表達(dá)基因。
　　對(duì)這13個(gè)基因進(jìn)

6、行文獻(xiàn)挖掘和分析顯示:石榴皮對(duì)NAFLD的治療作用可能是通過上調(diào)LPL、CARM1、C1QBP、TFB2M等基因的表達(dá)，促進(jìn)甘油三酯水解，減少其在肝臟中的蓄積;增強(qiáng)肝細(xì)胞的抗氧化應(yīng)激能力以及維持線粒體功能的穩(wěn)定，進(jìn)而維持肝細(xì)胞的正常生物代謝;同時(shí)，還可能下調(diào)NR3C1基因的表達(dá)，降低血液中游離脂肪酸的濃度，緩解胰島素抵抗，從而達(dá)到治療NAFLD的功效。而NHP2、RPL10、RPS7、CAD、PCK2、SG15、OASL、TR UB1基