P311蛋白與金屬硫蛋白ⅡA相互作用位點(diǎn)的計(jì)算機(jī)預(yù)測(cè).pdf

1、P311蛋白廣泛表達(dá)于多種組織，它參與體內(nèi)細(xì)胞分化、調(diào)節(jié)其它蛋白/基因轉(zhuǎn)錄、創(chuàng)傷修復(fù)、腫瘤發(fā)生等多種正?；虍惓５纳飳W(xué)活動(dòng)。金屬硫蛋白是一類廣泛存在于生物界的低分子量富含半胱氨酸的金屬結(jié)合蛋白，因其獨(dú)特的生物學(xué)功能，近年來(lái)國(guó)內(nèi)外對(duì)金屬硫蛋白各方面的研究日益受到重視。經(jīng)實(shí)驗(yàn)研究發(fā)現(xiàn)，金屬硫蛋白亞型ⅡA(MT2A)參與P311基因表達(dá)，并起著關(guān)鍵性的調(diào)節(jié)作用，說(shuō)明它們之間存在著相互作用的關(guān)系。
　　 由于P311蛋白的結(jié)構(gòu)信息缺失，

2、因此，本文首先采用同源建模的方法構(gòu)建P311蛋白的三維結(jié)構(gòu)，并使用ProTable分析和Ramachandran圖驗(yàn)證了其合理性。
　　 其次，將配體金屬硫蛋白ⅡA與P311蛋白的模建結(jié)構(gòu)用Autodock4.0軟件進(jìn)行分子對(duì)接，分析二者之間的相互作用。在生成的10個(gè)對(duì)接結(jié)果中，篩選出最合理的結(jié)構(gòu)模型。
　　 最后通過(guò)對(duì)最終復(fù)合物的結(jié)構(gòu)分析，預(yù)測(cè)出了兩者的作用區(qū)域，并發(fā)現(xiàn)受體蛋白中殘基GLU14、SER48以及GLU56