41. acmg全外顯子測序指南.

1、ACMG全外顯子測序指南全外顯子測序指南摘要：摘要：美國醫(yī)學遺傳學與基因組學學會（ACMG）以前為序列突變的解釋提供了指導.1在過去十年中，隨著高通量測序的出現(xiàn)，測序技術迅速發(fā)展。通過采用和利用下一代測序，臨床實驗室正在進行基因分型，單基因，基因組，外顯子，基因組，轉(zhuǎn)錄組和遺傳疾病表觀遺傳學檢測的不斷增加的遺傳檢測目錄。由于復雜性增加，基因檢測的這種轉(zhuǎn)變伴隨著序列解釋的新挑戰(zhàn)。在這方面，ACMG于2013年召集了一個由ACMG，分子病理

2、學協(xié)會（AMP）和美國病理學家學會的代表組成的工作組，重新審視和修訂了序列突變解釋的標準和準則。該組由臨床實驗室主任和臨床醫(yī)生組成。本報告代表ACMG，AMP和美國病理學家利益相關者聯(lián)盟組成的工作組的專家意見。這些建議主要適用于臨床實驗室使用的遺傳檢測的范圍，包括基因分型，單基因，panel，外顯子和基因組。本報告建議使用具體的標準術語“致病性”，“可能致病性”，“不確定性意義”，“可能良性”和“良性”來描述在導致孟德爾病癥的基因中鑒定

3、的突變。此外，該建議描述了基于使用典型類型的突變證據(jù)（例如，群體數(shù)據(jù)，計算數(shù)據(jù)，功能數(shù)據(jù)，分離數(shù)據(jù)）的標準將突變分類為這五個類別的過程。由于本報告中描述的臨床基因檢測的分析和解釋的復雜性增加，ACMG強烈建議臨床分子遺傳學檢測應在經(jīng)過臨床實驗室改進修訂批準的實驗室進行，結果由相關職業(yè)認證的臨床分子遺傳學家或分子遺傳病理學家或同等學科專家進行解釋。關鍵詞：關鍵詞：ACMG實驗室指導臨床遺傳檢測解釋；報告序列變異術語；突變報告前言前言臨床分

4、子實驗室正在不斷增加檢測的新的序列突變，因為在檢測患者標本時不斷發(fā)現(xiàn)大量與基因疾病相關的基因。雖然一些表型與單個基因相關，但許多與多個基因相關。我們對任何給定序列突變的臨床意義的理解是循序漸進的，其范圍從那些幾乎肯定是疾病致病性突變到幾乎肯定是良性的突變。雖然以前的美國醫(yī)學遺傳學和基因組學會（ACMG）的建議提供了序列突變的解釋類別和解釋算法，但是這些建議沒有提供定義的術語或詳細的突變分類指南.1。本報點和良性標準的負點，從而對所以突變

5、的分類進行了定義。通過觀眾回應系統(tǒng)，參與者被問及如何在評估突變證據(jù)時對每個標準（強，中等或支持或不使用）進行加權。同樣，這些答復也納入了這里介紹的分類系統(tǒng)。應該指出的是，雖然大多數(shù)答復者都贊成一個積分制，但工作組認為，為每個標準指定具體要點意味著對目前不支持科學評估的每個標準的定量水平的理解，并沒有考慮到解釋遺傳證據(jù)的復雜性。工作組還對來自其他專業(yè)社會和工作組的建議進行了評估，其中已經(jīng)制定了乳腺癌，結腸癌和囊性纖維化中良好基因的變異分類

6、指南，以及用于定量評估選擇性疾病變異的統(tǒng)計分析程序.25。雖然這些突變分析指南在特定環(huán)境中是有用的，但是很難將其提出的標準應用于所有基因和不同的實驗室設置。本文中描述的突變分類方法適用于所有孟德爾基因的突變，無論是通過單基因檢測，多基因定位，外顯子測序還是基因組測序鑒定。我們期望隨著技術和知識的改進，這種突變分類方法將會發(fā)展。我們還應該注意，在特定疾病組中工作的那些人應該繼續(xù)制定關于特定基因中突變分類的更集中的指導，因為賦予某些標準的適

7、用性和重量可能因基因和疾病而異。一般考慮一般考慮術語術語突變被定義為核苷酸序列的永久變化，而多態(tài)性定義為頻率高于1％的突變。然而，廣泛使用的術語“突變”和“多態(tài)性”通常分別導致由于不良假定的致病性和良性效應而引起的混淆。因此，建議將兩個術語用術語“突變”替換為以下修飾物：（i）致病性，（ii）可能的致病性，（iii）不確定的意義，（iv）可能良性或（v）良性。雖然這些修飾劑可能不涉及所有人類表型，但是它們包括與本指南中所述的與孟德爾病有