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文檔簡介
1、目的:該研究中擬用Illumina Miseq高通量測序技術(shù)分析甘肅省43名受試人群的唾液菌群結(jié)構(gòu)多樣性,同時(shí)測定樣本pH及鐵元素含量并分析唾液微生物群落結(jié)構(gòu)多樣性與pH、鐵元素的相關(guān)性,為深入了解齲病的發(fā)病原因及發(fā)展過程奠定理論基礎(chǔ),為預(yù)防及治療齲病提供新的研究思路。
方法:選取年齡為24~56歲受試人群43人,其中齲病組唾液樣本21例(CA組,DMFT≥1),健康組唾液樣本22例(HE組,DMFT=0)。提取樣本細(xì)菌DNA
2、,利用Illumina MiSeq測序平臺(tái)對43例樣本DNA的16S rRNA V3-V4區(qū)進(jìn)行測序,對結(jié)果進(jìn)行生物信息學(xué)分析。并對兩組唾液樣本pH及鐵元素含量進(jìn)行檢測,后采用RDA分析43例樣本與唾液pH及鐵元素的相關(guān)性。
結(jié)果:1. Beta多樣性分析結(jié)果顯示:兩組樣本的微生物群落結(jié)構(gòu)呈現(xiàn)出不同的特點(diǎn),該差異受豐度不同的影響;菌群結(jié)構(gòu)在各樣本間的差異表現(xiàn)為CA組更大。
2.齲病組與健康組的優(yōu)勢菌門分別為:變形菌門
3、(Proteobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、厚壁菌門(Firmicutes)、梭桿菌門(Fusobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)、螺旋體門(Spirochaetes);優(yōu)勢菌屬分別為:奈瑟菌屬(Neisseria)、鏈球菌屬(Streptococcus)、普雷沃菌屬(Prevotella)、卟啉單胞菌屬(Porphyromonas)、Lautropia、擬普雷沃菌屬(Allopr
4、evotella)、密螺旋體屬(Treponema)、梭桿菌屬(Fusobacterium)、二氧化碳嗜纖維菌屬(Capnocytophaga)、韋榮球菌屬(Veillonella)、嗜血桿菌屬(Terrahaemophilus)、纖毛菌屬(Leptotrichia)、放線菌屬(Actinomyces)、新月形單胞菌屬(Selenomonas)、迪茨氏菌屬(Dietzia)、顆粒鏈菌屬(Granulieatell)。
3.擬桿
5、菌門和卟啉單胞菌屬的相對豐度在HE組更高;而新月形單胞菌屬和迪茨氏菌屬的相對豐度則在CA組中更高(P<0.05)。
4.存在20種低豐度(相對豐度<0.01%)菌屬:雙歧桿菌(Bifidobacterium)、腸桿菌屬(Enterobacter)、紅環(huán)菌屬(Rhodocyclus)、Pseudomonas、不動(dòng)桿菌屬(Acinetobacter)、丙酸桿菌屬(Propionibacterium)、纖發(fā)菌屬(Leptothrix
6、)、代爾夫特菌屬(Delftia)、歐陸森氏菌(Olsenella)、羅爾斯通菌屬(Ralstonia)、乳球菌屬(Lactococcus)、芽孢桿菌屬(Bacillus)、光岡菌屬(Mitsuokella)、葡萄球菌屬(Staphylococcus)、埃希氏桿菌屬(Escherichia)、斯萊克氏菌屬(Slackia)、短波單胞菌屬(Brevundimonas)、Scardovia、赤微菌屬(Erythromicrobium)、營養(yǎng)
7、缺陷菌屬(Abiotrophia),以上各菌屬皆呈現(xiàn)出在CA組中相對豐度更高的特點(diǎn)(P<0.05)。
5.物種網(wǎng)絡(luò)分析圖顯示在齲病組中相對豐度更高(P<0.05)的丙酸桿菌屬與新月形單胞菌屬存在正相關(guān)關(guān)系;迪茨氏菌屬則間接與丙酸桿菌屬存在正相關(guān)關(guān)系。
6.功能基因測序結(jié)果顯示,兩組樣本相對豐度較高的功能基因分別為膜運(yùn)輸功能(Membrane Transport)、復(fù)制和修復(fù)功能(Replication and Rep
8、air)、氨基酸代謝功能(Amino Acid Metabolism)以及碳水化合物代謝功能(Carbohydrate Metabolism)。
7.唾液pH檢測檢測結(jié)果顯示:CA組pH低于HE組pH(P<0.05);鐵元素檢測結(jié)果為:CA組Fe含量高于HE組Fe含量(P<0.05)。
8.43個(gè)樣本與pH及鐵元素作為環(huán)境因子進(jìn)行RDA分析,結(jié)果顯示齲病組與鐵元素存在正相關(guān)關(guān)系,與pH成負(fù)相關(guān)關(guān)系。
結(jié)論:
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