齲病人群唾液菌群結構多樣性及其與pH、鐵的相關性研究.pdf

1、目的：該研究中擬用Illumina Miseq高通量測序技術分析甘肅省43名受試人群的唾液菌群結構多樣性，同時測定樣本pH及鐵元素含量并分析唾液微生物群落結構多樣性與pH、鐵元素的相關性，為深入了解齲病的發(fā)病原因及發(fā)展過程奠定理論基礎，為預防及治療齲病提供新的研究思路。
　　方法：選取年齡為24~56歲受試人群43人，其中齲病組唾液樣本21例(CA組，DMFT≥1)，健康組唾液樣本22例(HE組，DMFT=0)。提取樣本細菌DNA

2、，利用Illumina MiSeq測序平臺對43例樣本DNA的16S rRNA V3-V4區(qū)進行測序，對結果進行生物信息學分析。并對兩組唾液樣本pH及鐵元素含量進行檢測，后采用RDA分析43例樣本與唾液pH及鐵元素的相關性。
　　結果：1. Beta多樣性分析結果顯示：兩組樣本的微生物群落結構呈現(xiàn)出不同的特點，該差異受豐度不同的影響；菌群結構在各樣本間的差異表現(xiàn)為CA組更大。
　　2.齲病組與健康組的優(yōu)勢菌門分別為：變形菌門

3、(Proteobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、厚壁菌門(Firmicutes)、梭桿菌門(Fusobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)、螺旋體門(Spirochaetes)；優(yōu)勢菌屬分別為：奈瑟菌屬(Neisseria)、鏈球菌屬(Streptococcus)、普雷沃菌屬(Prevotella)、卟啉單胞菌屬(Porphyromonas)、Lautropia、擬普雷沃菌屬(Allopr

4、evotella)、密螺旋體屬(Treponema)、梭桿菌屬(Fusobacterium)、二氧化碳嗜纖維菌屬(Capnocytophaga)、韋榮球菌屬(Veillonella)、嗜血桿菌屬(Terrahaemophilus)、纖毛菌屬(Leptotrichia)、放線菌屬(Actinomyces)、新月形單胞菌屬(Selenomonas)、迪茨氏菌屬(Dietzia)、顆粒鏈菌屬(Granulieatell)。
　　3.擬桿

5、菌門和卟啉單胞菌屬的相對豐度在HE組更高；而新月形單胞菌屬和迪茨氏菌屬的相對豐度則在CA組中更高(P<0.05)。
　　4．存在20種低豐度(相對豐度<0.01％)菌屬：雙歧桿菌(Bifidobacterium)、腸桿菌屬(Enterobacter)、紅環(huán)菌屬(Rhodocyclus)、Pseudomonas、不動桿菌屬(Acinetobacter)、丙酸桿菌屬(Propionibacterium)、纖發(fā)菌屬(Leptothrix

6、)、代爾夫特菌屬(Delftia)、歐陸森氏菌(Olsenella)、羅爾斯通菌屬(Ralstonia)、乳球菌屬(Lactococcus)、芽孢桿菌屬(Bacillus)、光岡菌屬(Mitsuokella)、葡萄球菌屬(Staphylococcus)、埃希氏桿菌屬(Escherichia)、斯萊克氏菌屬(Slackia)、短波單胞菌屬(Brevundimonas)、Scardovia、赤微菌屬(Erythromicrobium)、營養(yǎng)

7、缺陷菌屬(Abiotrophia)，以上各菌屬皆呈現(xiàn)出在CA組中相對豐度更高的特點(P<0.05)。
　　5.物種網(wǎng)絡分析圖顯示在齲病組中相對豐度更高(P<0.05)的丙酸桿菌屬與新月形單胞菌屬存在正相關關系；迪茨氏菌屬則間接與丙酸桿菌屬存在正相關關系。
　　6.功能基因測序結果顯示，兩組樣本相對豐度較高的功能基因分別為膜運輸功能(Membrane Transport)、復制和修復功能(Replication and Rep

8、air)、氨基酸代謝功能(Amino Acid Metabolism)以及碳水化合物代謝功能(Carbohydrate Metabolism)。
　　7.唾液pH檢測檢測結果顯示：CA組pH低于HE組pH(P<0.05)；鐵元素檢測結果為：CA組Fe含量高于HE組Fe含量(P<0.05)。
　　8.43個樣本與pH及鐵元素作為環(huán)境因子進行RDA分析，結果顯示齲病組與鐵元素存在正相關關系，與pH成負相關關系。
　　結論：