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文檔簡介
1、目的:利用高通量測序平臺(tái),通過對(duì)齲病、牙周炎及口腔健康者的唾液微生物進(jìn)行測序,以探索致齲、致牙周病變的微生物群落機(jī)制,為口腔疾病的防治提供實(shí)驗(yàn)室依據(jù)。
方法:以WHO采樣標(biāo)準(zhǔn)收集健康者、齲病患者、牙周炎患者唾液樣本各10例,分別標(biāo)記為:H組、C組、P組。提取其唾液樣本DNA,PCR擴(kuò)增16S rDNA V4區(qū)并用Illumina MiSeq進(jìn)行測序,應(yīng)用Qiime、Mothur、Megan、SPSS等軟件進(jìn)行微生物群多樣性及結(jié)
2、構(gòu)分析。
結(jié)果:1.30個(gè)優(yōu)質(zhì)樣本,共得到1046647條優(yōu)質(zhì)序列,平均長度223bp;
2.共測得17,796個(gè)OTUs,歸屬于28個(gè)門(H組26個(gè),C組24個(gè),P組25個(gè)),506個(gè)屬(H組390個(gè),C組357個(gè),P組378個(gè)),其中優(yōu)勢菌門H組7個(gè)、C組7個(gè)、P組9個(gè),優(yōu)勢菌屬H組36個(gè)、C組33個(gè)、P組34個(gè);
3.在含量大于1%的菌屬中,放線菌屬、羅氏菌屬、鏈球菌屬、奈瑟菌屬及放線桿菌屬共同存在于
3、各組中;
4.優(yōu)勢菌門組間差異:擬桿菌門在H組中豐度較高,放線菌門、TM7菌門在P組中豐度較高(p<0.05);
5.優(yōu)勢菌屬組間差異:乏養(yǎng)菌屬、顆粒鏈菌屬、乳球菌屬在H組中較高,羅氏菌屬、巨球菌屬在P組中較高;孿生菌屬和顆粒鏈菌屬C組大于P組(p<0.05)。
結(jié)論:1.健康、齲病、牙周炎者口腔群落結(jié)構(gòu)有所不同,且疾病組菌群構(gòu)成相對(duì)單一;
2.部分菌門、菌屬豐度與齲病、牙周炎發(fā)病率具有相關(guān)性;<
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