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文檔簡介
1、目的:
RNAaseⅢ家族核糖核酸內(nèi)切酶Dicer在上皮性卵巢癌中低表達并且與疾病的進展和生存期短相關(guān)。本研究旨在探究上皮性卵巢癌細胞中Dicer低表達所引起的蛋白組學改變,并尋找Dicer下游關(guān)鍵靶蛋白,以明確 Dicer調(diào)控卵巢癌細胞惡性生物學行為的分子機制。
方法:
1.構(gòu)建特異性靶向沉默Dicer基因的短發(fā)卡RNA(shDicer)質(zhì)粒,并連入慢病毒質(zhì)粒載體。shDicer轉(zhuǎn)染上皮性卵巢癌細胞 A2
2、780,CAOV3和 SKOV3,構(gòu)建穩(wěn)定低表達Dicer的卵巢癌細胞轉(zhuǎn)染株。
2.實時熒光定量PCR(qRT-PCR)和蛋白免疫印跡(WB)檢測三組細胞系中Dicer表達的下調(diào)效率。 EdU增殖實驗,Wound-healing和Transwell遷移實驗檢測下調(diào)Dicer表達后,卵巢癌細胞的惡性增殖和遷移能力的變化。
3.雙向電泳(Two-dimensional electrophoresis,2-DE)技術(shù)檢測上
3、皮性卵巢癌細胞CAOV3-shNC和CAOV3-shDicer蛋白表達,并從中挑選出變化最為顯著的蛋白點(表達差異大于2倍)使用液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜法(LC-MS/MS)檢測,同時利用qRT-PCR和WB對這些蛋白點的差異表達進行驗證?;诓町惐磉_,蛋白功能以及蛋白間相互作用分析,我們篩選出 Dicer下游關(guān)鍵蛋白 PDIA3。Targetscan軟件預測,能夠特異性結(jié)合并且調(diào)控PDIA3表達的microRNAs為miR-148a和miR
4、-494,同時,qRT-PCR檢測miR-148a和miR-494在Dicer低表達的細胞株中的表達水平。
4.構(gòu)建兩個靶向沉默PDIA3基因的小干擾RNA(siRNA),轉(zhuǎn)染穩(wěn)定下調(diào)Dicer的上皮性卵巢癌細胞A2780、CAOV3和SKOV3。qRT-PCR和 WB檢測PDIA3的敲除效率。EdU增殖實驗,Wound-healing和 Transwell遷移實驗分別檢測下調(diào) PDIA3對Dicer沉默后引起卵巢癌細胞惡性增
5、殖,遷移能力改變的影響。
5.建立卵巢癌裸鼠皮下瘤模型,每組5只裸鼠,共五組。分別為SKOV3-shNC,SKOV3-shDicer、SKOV3-shDicer+siPDIA3-1、SKOV3-shDicer+siPDIA3-2和SKOV3-shDicer+5%Glucose。每兩天測量一次皮下瘤的大小并觀察記錄裸鼠一般情況(體重和飲食量)。
6.裸鼠處死后,取出皮下瘤,一部分液氮保存,另一部分石蠟包埋。qRT-PC
6、R和免疫組織化學法檢測移植瘤中 PDIA3、miR-148a和 miR-494的表達量以及皮下瘤組織切片中增殖標志物Ki-67,腫瘤上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(Epithelial-mesenchymal transition, EMT)途徑上皮表型E-cadherin和間質(zhì)表型Vimentin的表達水平。
結(jié)果:
1. A2780、CAOV3和SKOV3轉(zhuǎn)染shDicer后Dicer的mRNA水平和蛋白水平表達均下降了60-70
7、%。與對照組(轉(zhuǎn)染shNC的卵巢癌細胞)相比,穩(wěn)定轉(zhuǎn)染shDicer的卵巢癌細胞增殖和遷移能力均明顯增強。
2.雙向電泳結(jié)果顯示與CAOV3-shNC相比,CAOV3-shDicer細胞中的蛋白數(shù)量明顯較多(294±7 VS422±70,p=0.0132)。經(jīng)過PDQuest軟件分析后,挑選出表達量改變大于2倍蛋白中表達差異最明顯的30個蛋白點做LC-MS/MS鑒定,除去未成功鑒定的和重復的蛋白點,最后共得到26個有意義的蛋白
8、。
3. String10蛋白相互作用分析數(shù)據(jù)庫和DAVID蛋白功能分析網(wǎng)站解析了26個蛋白點與Dicer之間的相互關(guān)系;最終挑選出了7個與Dicer存在相互作用并且在卵巢癌生物學進展中起著重要作用的靶蛋白。qRT-PCR和WB進一步驗證了在下調(diào)Dicer的三株卵巢癌細胞中這7個靶蛋白的表達量改變,經(jīng)過對蛋白表達量的變化和蛋白功能的分析,我們得出PDIA3蛋白最有可能成為Dicer下游的關(guān)鍵靶蛋白,并且沉默Dicer表達后,卵
9、巢癌細胞A2780,CAOV3和SKOV3中PDIA3的表達水平升高,而miR-148a和miR-494的表達顯著降低。
4.沉默PDIA3表達后,下調(diào)Dicer的卵巢癌細胞A2780,CAOV3和SKOV3的增殖和遷移能力受到明顯抑制。裸鼠在體試驗顯示下調(diào)Dicer的卵巢癌細胞組移植瘤體積明顯大于相應對照組,同時轉(zhuǎn)染了siPDIA3的低表達Dicer卵巢癌細胞組移植瘤的體積明顯小于對照的低表達Dicer細胞組。
5
10、. qRT-PCR和免疫組織化學法結(jié)果顯示 Dicer低表達組中 PDIA3表達水平升高,miR-148a和miR-494的表達水平降低;同時增殖標志物Ki-67的表達信號增強,EMT途徑相關(guān)上皮表型E-cadherin表達顯著降低而間質(zhì)表型Vimentin的表達明顯增多;同時轉(zhuǎn)染siPDIA3的低表達Dicer組中,Dicer下調(diào)的卵巢癌細胞移植瘤中PDIA3表達量減少,同時增殖標志物Ki-67的表達水平也降低,EMT途徑間質(zhì)表型Vi
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