高等植物液泡加工酶VPE家族的生物信息學(xué)分析及驗(yàn)證.pdf

1、本文以水稻和擬南芥液泡加工酶（VPE）家族為研究對(duì)象，對(duì)所有VPE成員進(jìn)行了初步的生物信息學(xué)分析，并且進(jìn)一步對(duì)部分VPE成員在細(xì)胞程序性死亡PCD過(guò)程中發(fā)揮的作用進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證，主要內(nèi)容如下：
　　 1.高等植物液泡加工酶VPE家族的生物信息學(xué)分析
　　 利用已知的植物液泡加工酶（vacuolar processing enzyme，VPE）蛋白家族的Peptidase_C13結(jié)構(gòu)域序列為檢索序列，對(duì)擬南芥和水稻中的VP

2、E家族成員進(jìn)行序列分析，同時(shí)利用所有成員的氨基酸序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)，并對(duì)其中的保守序列以及信號(hào)肽區(qū)段和亞細(xì)胞定位進(jìn)行了分析。結(jié)果表明：1）結(jié)合同源序列的搜索和結(jié)構(gòu)域的鑒定，最終在擬南芥和水稻中分別確定了8個(gè)和13個(gè)VPEs，其中2個(gè)擬南芥和11個(gè)水稻VPE成員為本文首次報(bào)道；2）蛋白系統(tǒng)發(fā)生分析表明，該基因家族的基本特征在擬南芥和水稻物種分離之前就已經(jīng)形成；3）多序列聯(lián)配以及MEME分析表明，Peptidase_C13結(jié)構(gòu)域在VPE家族

3、成員間高度保守。4）亞細(xì)胞定位分析表明，VPE成員定位于細(xì)胞中的不同區(qū)域，定位于液泡中的占多數(shù).
　　 2.鹽脅迫誘導(dǎo)水稻根尖細(xì)胞PCD過(guò)程中VPE轉(zhuǎn)錄水平變化
　　 在上述基礎(chǔ)上本文進(jìn)一步研究了鹽脅迫誘導(dǎo)水稻根尖細(xì)胞PCD過(guò)程中，水稻VPE家族兩個(gè)成員OsVPE1和OsVPE8轉(zhuǎn)錄水平的差異。結(jié)果表明，500mMNaCl誘導(dǎo)水稻根尖細(xì)胞PCD發(fā)生過(guò)程中，OsVPE1和OsVPE8基因轉(zhuǎn)錄水平顯著升高，提示液泡加工酶可能