多通路基因檢測(cè)用于預(yù)測(cè)乳腺癌新輔助化療療效的研究.pdf

1、乳腺癌是一種常見的惡性腫瘤疾病。它位居女性惡性腫瘤發(fā)病率的第一。臨床上新輔助化療作為治療乳腺癌的一種手段越來越廣泛應(yīng)用。采用新輔助化療可以縮小病灶，利于腫瘤切除及增加保乳手術(shù)機(jī)會(huì)。但是有部分患者對(duì)新輔助化療不敏感，這需要多種潛在的指標(biāo)對(duì)乳腺癌新輔助化療的療效進(jìn)行預(yù)測(cè)將有效提高預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性。
　　本研究從浙江省腫瘤醫(yī)院共收集到32例新輔助化療前乳腺癌組織樣本，根據(jù)化療后的療效分為兩組，達(dá)到病理完全緩解（pCR）組和非病理完全緩解(N

2、pCR)組。首先將3例乳腺癌患者新輔助化療后達(dá)到pCR效果的化療前樣本和3例未達(dá)到pCR效果的樣本進(jìn)行多樣本混合構(gòu)建文庫(kù)進(jìn)行高通量測(cè)序。通過對(duì)測(cè)序結(jié)果分析，篩選出差異表達(dá)的基因，并將差異表達(dá)基因進(jìn)行GO和KEGG功能富集。熒光定量分析目標(biāo)通路基因在15例pCR和17例NpCR樣本中的差異表達(dá)情況，結(jié)合年齡、雌激素受體水平、孕激素受體水平、HER2臨床指標(biāo)進(jìn)行分析其相關(guān)性。對(duì)比TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)分析目標(biāo)基因在971例乳腺癌組織樣本中的表達(dá)水平

3、，分析其總生存期和無病生存期，推測(cè)其和乳腺癌新輔助化療敏感性的關(guān)系。
　　研究發(fā)現(xiàn)，通過高通量測(cè)序，共獲得出715條差異表達(dá)的基因，然后將篩選出來的差異表達(dá)基因進(jìn)行GO和KFGG功能富集，得到PSMB10、UBD、UBE2C、UBE2S、CCL2、CCR1、CXCL10、CXCL11、IL2RG這9個(gè)與泛素介導(dǎo)的蛋白酶體水解途徑，細(xì)胞因子和其受體間相互作用途徑有關(guān)的差異表達(dá)基因。熒光定量結(jié)果顯示，這9條基因在pCR和NpCR組織樣

4、本中的表達(dá)水平具有顯著的差異性，在乳腺癌患者新輔助化療后達(dá)到pCR組織樣本中顯著高表達(dá)。本課題為了驗(yàn)證在這32例乳腺癌組織樣本中兩條通路基因的表達(dá)量能否預(yù)測(cè)乳腺癌新輔助化療療效，我們建立一個(gè)了邏輯回歸方程來預(yù)測(cè)。從TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)現(xiàn)PSMB10、UBD、UBE2C、CXCL10、CXCL11、IL2RG高表達(dá)的患者的總生存期、無病生存期明顯長(zhǎng)于低表達(dá)的患者，預(yù)后較好。因此我們推測(cè)這9條基因高表達(dá)的乳腺癌患者可能更適合新輔助化療治療，達(dá)到