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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
應(yīng)激顆粒(Stress Granules,SGs)與加工體(Processing Bodies,PBs)是真核細(xì)胞受到氧化應(yīng)激、熱休克、紫外線照射及病毒感染等各種環(huán)境刺激時(shí)在胞漿中產(chǎn)生的與mRNA代謝密切相關(guān)的顆粒狀結(jié)構(gòu)。本課題組前期結(jié)果表明當(dāng)HeLa細(xì)胞受到外界刺激,如0.5mM亞砷酸鈉氧化應(yīng)激或45℃熱休克時(shí),Tudor-SN(Tudor Staphylococcal Nuclease)蛋白可以參與胞漿中SGs的組
2、裝,但深入的分子機(jī)制尚不完全清楚。本課題旨在進(jìn)一步分析Tudor-SN蛋白的應(yīng)激動(dòng)力學(xué)屬性及其在SGs組裝動(dòng)力學(xué)中的作用機(jī)制。
方法:
本課題實(shí)驗(yàn)分為三大部分,
第一部分:①利用細(xì)胞免疫熒光(Immunofluorescence,IF)、質(zhì)粒轉(zhuǎn)染-共聚焦顯微鏡分析Tudor-SN蛋白顆粒與SGs/PBs的共定位關(guān)系;②利用熒光漂白后恢復(fù)(Fluorescence recovery after photobl
3、eaching,F(xiàn)RAP)技術(shù)分析HeLa細(xì)胞中Tudor-SN蛋白顆粒的胞內(nèi)應(yīng)激動(dòng)力學(xué)屬性;③利用熒光漂白損失(Fluorescence loss in photobleaching,F(xiàn)LIP)技術(shù)分析Tudor-SN蛋白的核/漿穿梭屬性及與SGs組裝的相關(guān)性分析。
第二部分:①利用AKTA純化系統(tǒng)、免疫共沉淀(Co-immunoprecipitation,Co-IP)、質(zhì)粒轉(zhuǎn)染、GST融合蛋白釣?。℅ST-pulldown
4、)技術(shù)進(jìn)行SGs中包含Tudor-SN的蛋白應(yīng)激復(fù)合物分析;②利用 Oligo(dT)親和層析、細(xì)胞熒光原位雜交(Fluorescence in situ hybridization,F(xiàn)ISH)、RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀(RNA-binding protein immunoprecipitation,RIP)等技術(shù)分析SGs中Tudor-SN蛋白與poly(A)+mRNA、AGTR1-3'UTR的結(jié)合及共定位關(guān)系。
第三部分:①
5、利用GFP-shRNA干擾和熒光漂白后恢復(fù)(FRAP)技術(shù)分析HeLa細(xì)胞中Tudor-SN對(duì)于SGs/PBs蛋白組裝動(dòng)力學(xué)的影響;②以Tudor-SN基因敲除(Tudor-SN-/-)小鼠胚胎成纖維細(xì)胞(mouse embryonic fibroblasts,MEFs)為實(shí)驗(yàn)對(duì)象,分析 Tudor-SN對(duì)于 poly(A)+ mRNA應(yīng)激顆粒形成的影響;③利用siRNA干擾和多聚核糖體解聚曲線分析研究Tudor-SN蛋白與多聚核糖體應(yīng)
6、激解聚的相關(guān)性;④以AGTR1-3'UTR(3'-untranslated region of angiotensin II receptor,type1 mRNA)為具體靶基因,利用GFP-MS2系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)AGTR1-3'UTR的活細(xì)胞內(nèi)動(dòng)態(tài)標(biāo)記,并結(jié)合siRNA干擾、dsRed-shRNA干擾、熒光漂白后恢復(fù)(FRAP)、細(xì)胞免疫熒光、活細(xì)胞工作站等技術(shù)分析Tudor-SN蛋白對(duì)AGTR1-3'UTR應(yīng)激動(dòng)力學(xué)行為的調(diào)控作用。
7、 結(jié)果:
第一部分:①HeLa細(xì)胞內(nèi)源性Tudor-SN蛋白與SGs標(biāo)記蛋白(HuR、PABP1、G3BP)存在顆粒共定位關(guān)系,與SGs/PBs共同蛋白(AGO1/2)部分共定位,但與PBs標(biāo)記蛋白(DCP1a、GW182)并無(wú)共定位關(guān)系;外源性RFP-Tudor-SN融合蛋白與GFP-AGO2蛋白存在一定的顆粒共定位關(guān)系,但不與GFP-DCP1a/b、GFP-DCP2、GFP-GW182以及GFP蛋白共定位。②給予細(xì)胞高強(qiáng)
8、度激光漂白后,興趣區(qū)Tudor-SN蛋白顆粒的熒光強(qiáng)度降低到原來(lái)的~23%,隨后熒光信息恢復(fù)至漂白前熒光強(qiáng)度的~66.3%,光漂白后恢復(fù)速率 t1/2值為9.22±1.72sec。③給予細(xì)胞脈沖式重復(fù)光漂白后,興趣區(qū)Tudor-SN蛋白顆粒熒光信號(hào)完全消失,伴隨同一細(xì)胞內(nèi)鄰近檢測(cè)區(qū)Tudor-SN蛋白顆粒和細(xì)胞胞核內(nèi)Tudor-SN蛋白熒光信號(hào)的逐漸降低。
第二部分:①Tudor-SN蛋白可以與TIAR、AGO1/2、PABP
9、1、eIF5A、HuR、TTP等蛋白形成應(yīng)激復(fù)合物,但不包含 DCP1a蛋白,另外,Tudor-SN蛋白的SN1結(jié)構(gòu)域是介導(dǎo)其與PABP1、TIAR、AGO1/2蛋白結(jié)合作用的主要功能片段。②Tudor-SN可通過(guò)RNA的橋聯(lián)作用與PABP1蛋白結(jié)合,還可與poly(A)+mRNA、AGTR1-3'UTR結(jié)合并共同定位于SGs結(jié)構(gòu)中。
第三部分:①與對(duì)照組相比,當(dāng)下調(diào) HeLa細(xì)胞內(nèi) Tudor-SN蛋白表達(dá)時(shí),SGs顆粒興趣
10、區(qū)光漂白后恢復(fù)速率t1/2值由4.35±1.26sec升至7.01±1.55sec(P<0.05),而PBs顆粒興趣區(qū)t1/2值差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。②Tudor-SN基因敲除不能完全阻止但可有效抑制 poly(A)+mRNA應(yīng)激顆粒的形成。③應(yīng)激狀態(tài)下,以放線菌酮或嘌呤霉素干擾多聚核糖體解聚過(guò)程可以影響Tudor-SN應(yīng)激顆粒的胞漿組裝,而以siRNA干擾技術(shù)下調(diào)細(xì)胞內(nèi)Tudor-SN的表達(dá),并未觀察到多聚核糖體應(yīng)激解聚過(guò)程的改變。④利用
11、GFP-MS2系統(tǒng)構(gòu)建pT7-AGTR1-3'UTR-24×MS2重組真核質(zhì)粒,在活細(xì)胞內(nèi)成功實(shí)現(xiàn)對(duì)于AGTR1-3'UTR的GFP標(biāo)記,后者與Tudor-SN蛋白呈現(xiàn)相同的顆粒組裝過(guò)程。當(dāng)下調(diào)細(xì)胞內(nèi) Tudor-SN蛋白表達(dá)時(shí),AGTR1-3'UTR顆粒組裝過(guò)程受到影響。給予細(xì)胞高強(qiáng)度激光漂白處理,AGTR1-3'UTR顆粒興趣區(qū)光漂白后恢復(fù)速率 t1/2值由9.96±0.78sec升至16.77±1.94sec(P<0.05)。
12、r> 結(jié)論:
1)Tudor-SN蛋白是一種 SGs特異性蛋白,具有核漿穿梭特性,后者參與Tudor-SN蛋白顆粒呈現(xiàn)高度動(dòng)態(tài)性的組裝過(guò)程。2)Tudor-SN與PABP1、TIAR等多種應(yīng)激蛋白以及poly(A)+mRNA相互作用,形成應(yīng)激蛋白-核酸復(fù)合物,共同參與細(xì)胞胞漿SGs結(jié)構(gòu)的形成。3)Tudor-SN蛋白對(duì)于多聚核糖體的應(yīng)激解聚過(guò)程并無(wú)影響,但可調(diào)控SGs蛋白-核酸成分(如G3BP蛋白、AGTR1-3'UTR)的
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