黑線倉鼠(Cricetulus barabensis)FSHβ基因研究與SSR座位篩選.pdf

1、嚙齒動物在維系生物群落的結(jié)構(gòu)和功能、生態(tài)系統(tǒng)物質(zhì)能量流動和物種多樣性等方面，起著極其重要的作用。近年來，嚙齒動物對不同棲息地造成的危害日益嚴(yán)峻。黑線倉鼠作為中國北方平原農(nóng)田的主要害鼠，其高繁殖力和對農(nóng)區(qū)危害之大，已經(jīng)引起人們越來越多的關(guān)注。 促卵泡素β亞基基因（FSHβ基因）是與動物繁殖性狀相關(guān)的基因。本研究根據(jù)GenBank數(shù)據(jù)庫中同源物種的FSHβ基因設(shè)計引物，PCR法首次在山東黑線倉鼠中克隆出FSHβ基因1198bp，隨

2、后又在沂南、臨朐和曲阜三個地理種群各30個黑線倉鼠個體中進(jìn)行擴(kuò)增和序列測定，結(jié)果發(fā)現(xiàn)13個SNPs，4個插入/缺失位點(diǎn)，轉(zhuǎn)換/顛換為8，共定義了13種單倍型，在GenBank注冊序列號為：FJ882151～FJ882163。實(shí)驗獲得的黑線倉鼠FSHβ基因mRNA序列與其它20個物種的相應(yīng)序列進(jìn)行比對，在核苷酸（78％～100％）水平和氨基酸（75％～100％）水平上有較高同源性。用DnaSPv4．10軟件分別計算三個地理種群黑線倉鼠FS

3、HB基因核苷酸多樣性（π）、單倍型多樣性（Hd）、單倍型數(shù)目（H）、多態(tài)位點(diǎn)數(shù)（S）、平均核苷酸差異數(shù)（K）和基于分離位點(diǎn)數(shù)目的多樣性（θw），發(fā)現(xiàn)遺傳多樣性水平具有沂南種群>曲阜種群>臨朐種群的特點(diǎn)。三個地理種群間的種群間遺傳分化系數(shù)（Fst）、基因流（Nm）和種群間的核苷酸歧異度（Dxy）顯示沂南、臨朐和曲阜三地黑線倉鼠FSHβ基因具有一定遺傳分化，但不顯著；種群間遺傳分化系數(shù)（Gst）顯示，有95％～99％的遺傳變異存在于種群內(nèi)部

4、。用MEGA4．0軟件對三個地理種群90個黑線倉鼠個體做NJ系統(tǒng)進(jìn)化分析，90個個體相互交織，證明三個地理種群黑線倉鼠遺傳分化不明顯。本研究發(fā)現(xiàn)山東地區(qū)黑線倉鼠FSHβ基因存在豐富的核苷酸多樣性和單倍型多樣性，F(xiàn)SHβ基因是否為控制黑線倉鼠繁殖力的主效基因需要進(jìn)一步研究。 為了進(jìn)一步補(bǔ)充黑線倉鼠的有關(guān)分子標(biāo)記，本研究還用構(gòu)建基因組文庫法篩選出黑線倉鼠篩選高變異SSR座位18個，在GenBank注冊序列號為：EF543177～E