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1、從四川臥龍中國(guó)保護(hù)大熊貓研究中心提供的野外放歸大熊貓“祥祥”的12份糞樣中進(jìn)行產(chǎn)纖維素酶細(xì)菌的分離,通過(guò)剛果紅染色法分離到51株能在“羧甲基纖維素鈉(CMC-Na)-剛果紅”平板上產(chǎn)生水解圈的菌株。挑選8株水解圈較大的菌株點(diǎn)種于“纖維素粉-剛果紅”平板進(jìn)行初篩,從中篩選出4株能在平板上產(chǎn)生水解圈的菌株,進(jìn)一步進(jìn)行搖瓶產(chǎn)酶復(fù)篩。最后得到一株傳代性質(zhì)穩(wěn)定、高酶活的菌株,經(jīng)初步鑒定為沙雷氏菌(Serratia)命名為Serratia JF-1
2、16。 沙雷氏菌Serratia JF-1116革蘭氏染色反應(yīng)為陰性,無(wú)芽孢,菌體成直桿狀,大小為0.5~08.μm×0.9~2.0μm,菌體兩端為圓形,兼性厭氧,有運(yùn)動(dòng)性。菌落白色濕潤(rùn),生長(zhǎng)溫度范圍為20~37℃,最適生長(zhǎng)溫度為28℃。該菌株可利用葡萄糖產(chǎn)酸,也能利用木糖、阿拉伯糖、甘露醇等產(chǎn)酸。過(guò)氧化氫酶呈陽(yáng)性,利用檸檬酸鹽和丙酸鹽,可分解明膠。硝酸鹽還原陽(yáng)性,M.R陰性、V.P陽(yáng)性,V.P培養(yǎng)物pH為5.4~6.5。
3、 用PCR技術(shù)擴(kuò)增了沙雷氏菌Serratia JF-1116的16S rDNA全序列,并對(duì)其進(jìn)行了克隆和測(cè)序,對(duì)該序列在GenBank中的BLAST結(jié)果表明,所有與該序列高度同源的序列都為腸桿菌科(Emerobacteriaceae)的16S rDNA基因序列,其中相似性最高的為serratia屬的菌株。該序列與serratia屬的幾個(gè)模式菌S.grimesii,S.proteamaculans,S.liquefaciens,S.fo
4、nticola的相似性分別為99.8%,99.4%,98.5%和97.5%。在此基礎(chǔ)上以一株芽孢桿菌(Bacillus subtilis)16SrDNA序列為外種群構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。用CLUSTAL W1.8進(jìn)行多序列比對(duì),采用PHYLIP軟件包構(gòu)建分子進(jìn)化樹(shù)。菌株JF-1116與3株Serratia聚類在一起,其中菌株JF-1116和S.grimesii親緣最近,其分支置信度為90%,結(jié)合分子進(jìn)化樹(shù)和生理生化鑒定的結(jié)果,將JF-1116
5、命名為格氏沙雷氏菌(S.grimesii)。菌株JF-1116進(jìn)行搖瓶產(chǎn)酶試驗(yàn)結(jié)果表明,以羧甲基纖維素鈉0.5%為碳源,蛋白胨1%為氮源,麩皮3%為添加物,在28℃,20%裝液量,搖床振蕩培養(yǎng)24h后,其發(fā)酵液濾紙酶活(FPA)可高達(dá)111.5u/mL。通過(guò)對(duì)其粗酶液的性質(zhì)進(jìn)行測(cè)定,該菌所產(chǎn)纖維素酶粗酶液中的FPA、CMCase和β-葡萄糖苷酶的最適產(chǎn)酶溫度分別為50℃、50℃、55℃。其中CMCase在pH4.2~5.4范圍內(nèi)酶活較高
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