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文檔簡介
1、目的:應(yīng)用功能蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法初步鑒定小鼠肝細胞中表皮生長因子(epidermal growth factor,EGF)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)的磷蛋白組成成分或效應(yīng)蛋白/酶,對這些磷蛋白在持續(xù)高濃度的EGF(10ng/μl,生理濃度為10-3~10-1ng/μl)刺激不同時間點的磷酸化水平進行半定量分析(獲得相對反應(yīng)速度數(shù)據(jù)),在細胞整體表達的水平上動態(tài)的觀察分析細胞內(nèi)激酶、信號蛋白等在EGF信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程中發(fā)生的動力學(xué)變化,以探討EGF對小鼠
2、肝細胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的動力學(xué)改變特點,并進一步分析EGF信號轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)中信號蛋白、信號途徑之間的相互交流、相互影響、相互作用和相互制約的關(guān)系及其對信號轉(zhuǎn)導(dǎo)最終生理效應(yīng)的影響。 方法:本實驗采用肝組織塊培養(yǎng)法,原代培養(yǎng)小鼠肝細胞作為實驗材料;32P同位素標記對照組與刺激組小鼠肝細胞磷蛋白;給予刺激組高濃度EGF(10ng/μl)分別作用0min、5min、20min、60min、120min等不同時間后,液氮終止反應(yīng);裂解細胞,收集蛋白,
3、Bio-Rad DC法定量蛋白;根據(jù)蛋白質(zhì)的等電點和分子量的不同,采用雙向凝膠電泳(一向采用pH3~10的固相pH梯度等電聚焦電泳,二向采用10%變性聚丙烯酰胺凝膠電泳)分離蛋白;電泳結(jié)束后,固定凝膠塊并進行干膠處理,將干膠片與X光膠片一起放入攝影暗匣,在-70℃冰箱中曝光7日:于自動洗片機內(nèi)沖洗X光膠片,獲得不同時間點的雙向凝膠電泳放射自顯影圖譜。采用PDQuest 2D分析軟件分析電泳圖譜中磷蛋白的等電點及分子量,將各磷蛋白點的實驗
4、數(shù)據(jù)與Swiss-Prot/TrEMBL蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫、磷蛋白數(shù)據(jù)庫(PPDB)及自建磷蛋白數(shù)據(jù)庫進行分子量、等電點及磷酸化狀態(tài)的相互比較,初步確定小鼠肝細胞EGF信號轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)的組成成分或效應(yīng)蛋白/酶等相關(guān)磷蛋白。運用PDQaaest 2D分析軟件分析相關(guān)磷蛋白在EGF刺激不同時間點的磷酸化水平的變化情況,繪制出相應(yīng)的時間動力學(xué)曲線。 結(jié)果:①雙向凝膠電泳放射自顯影圖譜顯示,對照組與刺激組磷酸化蛋白點數(shù)目基本相同,大約有100個蛋
5、白點,分子量在20~120 kDa,豐度較高的蛋白點主要集中在pH4~7的范圍內(nèi)。②經(jīng)PDQuest 2D分析,并結(jié)合Swiss-Prot/TrEMBL及PPDB等數(shù)據(jù)庫資源初步檢測到參與EGF信號轉(zhuǎn)導(dǎo)且豐度較高的相關(guān)磷蛋白有8種,分別是EGFR底物15(Eps15)、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)子(STAT1)、熱休克蛋白86(HSP86)、蛋白激酶Ca(PKCa)、細胞外信號調(diào)節(jié)激酶2(ERK2)、MAPK磷酸酶3(MKP3)、14-3-3蛋白α/β(
6、14-3-30α/β)、MAPK激酶6(MAPKK6)等;糖代謝相關(guān)蛋白有磷酸果糖激酶-1同工酶B(PFK-B)及糖原合酶底物(glycogenin-1)2種。③在細胞整體水平上,在持續(xù)高濃度的EGF刺激下,不同EGF相關(guān)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白的磷酸化時間動力學(xué)行為表現(xiàn)不同,大多數(shù)磷蛋白表現(xiàn)為峰型,其動力學(xué)曲線最高峰值在5分或20分;但少數(shù)磷蛋白的動力學(xué)行為卻表現(xiàn)為持續(xù)活化狀態(tài),在120分鐘后仍處于較高的磷酸化水平,如Eps15和ERK2。
7、 結(jié)論:①在細胞整體水平,持續(xù)高濃度的EGF刺激下,小鼠肝細胞內(nèi)EGF信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中大多數(shù)的磷蛋白都表現(xiàn)為激活后很快恢復(fù)到未刺激狀態(tài)。表明在細胞整體水平,信號途徑中磷蛋白表現(xiàn)的動力學(xué)行為是受到整個信號轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)整合后的動力學(xué)行為。從而可以認為,EGF信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑與其他信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑之間存在廣泛的相互作用及相互交流,并且這種相互作用對其最終生理效應(yīng)有影響;②EGF在生理濃度下可能表現(xiàn)為自適應(yīng)控制作用而正常發(fā)揮其調(diào)節(jié)細胞的生長、存活、增殖和分
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