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文檔簡介
1、目的:采用mRNA差異顯示反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈式反應技術(shù)(DDRT-PCR)篩選塔崗水庫淡水渦蟲饑餓誘導中的差異表達序列標簽(Express sequence tags,ESTs),探索淡水渦蟲抗饑餓生存的分子機理;對九產(chǎn)地淡水渦蟲的Hsp70序列進行分子系統(tǒng)學研究,對其系統(tǒng)演化關(guān)系進行了初步探討。 方法:饑餓誘導塔崗水庫的淡水渦蟲,在饑餓一個月時將其處死,提取總RNA,用mRNA差異顯示技術(shù)(DDRT-PCR)研究饑餓情況下差異表達
2、的基因,克隆與測序后用生物信息學方法對測序結(jié)果進行分析;克隆九產(chǎn)地淡水渦蟲Hsp70基因序列,進行分子系統(tǒng)學分析。 結(jié)果:運用mRNA差別顯示技術(shù)篩選饑餓渦蟲體內(nèi)的差別表達基因,獲得18條差異表達片段。6個為18srRNA,2個為28srRNA,1個為翻譯起始因子,1個為與日本三角渦蟲信使mRNA上與DjClg3表達有關(guān)的CaspaSe-3基因,1個與日本三角渦蟲DEAD box蛋白表達有關(guān)的信使mRNA同源序列,1個與Hsp7
3、0基因同源,1個與Hsp90基因同源,2個與Polaromonas藻JS666的基因組序列同源性最高,1個與Schmidtea mediterranea克隆H.67.8d的未知mRNA序列同源性最高,還有2個在Genbank中未找到同源序列。此外,我們還克隆了九個產(chǎn)地渦蟲的Hsp70部分cDNA序列,并用分子進化分析軟件Meg3.1軟件對其分析構(gòu)樹。九產(chǎn)地渦蟲Hsp70親緣關(guān)系顯示:信陽新縣農(nóng)科所、信陽寨溝和信陽息縣陳灣大橋下三地聚類一
4、枝,親緣關(guān)系較近;南陽淮源寺和南陽桐柏均屬桐柏山區(qū),聚為一個小枝;山西王莽嶺西部河錫崖村和山西王莽嶺錫崖溝下兩個產(chǎn)地同在王莽嶺風景區(qū)內(nèi),地理位置及環(huán)境都非常相似,聚為一個小枝:新鄉(xiāng)衛(wèi)輝塔崗水庫屬太行山區(qū),但與王莽嶺兩地距離關(guān)系而言,相對較遠,因此獨立為一枝;洛陽白云山屬伏牛山系,地理位置上與前八個產(chǎn)地相對比較遠,親緣關(guān)系較遠,故也單獨為一枝。 結(jié)論:初步篩選出18個饑餓誘導的差異表達ESTs,為功能基因的克隆與分析奠定了基礎(chǔ)。九
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