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文檔簡介
1、目的:
2型糖尿?。═ype2 diabetes mellitus,T2DM)是由遺傳與環(huán)境因素等多重因素共同作用而引起慢性葡萄糖代謝紊亂性疾病。表觀遺傳學(xué)是由 Waddington首次提出并用來闡述基因與環(huán)境之間的相互作用對疾病產(chǎn)生的影響。其中,DNA甲基化是T2DM發(fā)生發(fā)展中非常重要的表觀遺傳調(diào)控機制。本研究主要通過對 PTPN1及GLUD1基因的DNA甲基化研究,來探討其 DNA甲基化與 T2DM患病的相關(guān)性,從而為預(yù)測
2、 T2DM的發(fā)生發(fā)展提供可能的生物學(xué)標記。
材料和方法:
收集深圳南山慢性疾病控制中心非肥胖的T2DM患者及性別、年齡相匹配的正常對照組的外周血樣本各97例。通過 Lab-Aid核酸自動提取儀從外周血液中提取全基因組 DNA,將其亞硫酸鹽修飾后進行 PCR特異性擴增。采用焦磷酸測序技術(shù)檢測 PTPN1、GLUD1候選基因啟動子區(qū)域的DNA甲基化修飾水平。運用SPSS18.0統(tǒng)計軟件進行數(shù)據(jù)處理,分析 DNA甲基化與
3、T2DM患病及臨床特征的相關(guān)性。
結(jié)果:
通過焦磷酸測序技術(shù)檢測發(fā)現(xiàn)PTPN1基因啟動子區(qū)域CpG1-8的甲基化水平均高于正常對照組,有顯著的統(tǒng)計學(xué)意義(15.98±9.18 vs12.00±9.03,P=0.001;8.68±4.48 vs6.41±3.16,P=0.002;6.98±3.11 vs5.57±1.88,P=0.001;18.87±8.09 vs15.46±5.76,P=0.003;7.51±3.69
4、 vs6.23±1.75,P=0.007;5.21±1.24 vs4.60±0.87,P=0.001;5.15±1.60 vs4.84±1.39,P=0.036;4.89±0.76 vs4.37±0.70,P=0.001);按性別分層后進行分析發(fā)現(xiàn),在女性中 T2DM的PTPN1基因啟動子區(qū)域的平均甲基化水平與 T2DM的患病具有顯著相關(guān)(P=4.82E-04);此外,在女性中 PTPN1平均甲基化程度與低密度脂蛋白、總膽固醇呈負相關(guān)性
5、
?。╮=-0.183,P=0.046;r=-0.310,P=0.001);而在男性中 PTPN1平均甲基化程度與年齡呈正相關(guān)性(r=0.276,P=0.017)。GLUD1基因啟動子區(qū)域 CpG1-5的甲基化水平均低于正常對照組,有顯著的統(tǒng)計學(xué)意義(3.87±3.64 vs4.36±1.96,P=0.003;9.77±6.44 vs13.16±7.16,P=2.93E-04;3.48±3.32 vs3.52±1.22,P=0.
6、022;18.57±5.62 vs14.56±6.55,P=3.31E-05;3.75±3.24 vs5.11±2.21,P=4.01E-05);按性別分層后進行分析發(fā)現(xiàn),在女性中 T2DM的GLUD1基因啟動子區(qū)域的平均甲基化水平與 T2DM的患病具有顯著相關(guān)(P=0.001);此外,盡管在男性中 T2DM的GLUD1平均甲基化水平與對照組無顯著差異,但GLUD1平均甲基化程度與肌酐值呈負相關(guān)性(r=-0.290,P=0.013)。<
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