基于數(shù)據融合的生物網絡推斷.pdf

1、科技迅速發(fā)展產生大量不同類型的生物數(shù)據。每種數(shù)據從不同的角度，提供獨立且互補的信息。通過數(shù)據融合技術，可以構建復雜的生物網絡。其中，蛋白質間相互作用網絡和疾病與基因關聯(lián)網絡是后基因組時代兩個研究的焦點。蛋白質間相互作用網絡對理解蛋白質功能有著重要的作用，而隨著精準醫(yī)學計劃的推進，疾病與基因關聯(lián)網絡的構建也變得日益重要。本文針對這兩個問題提出相應的數(shù)據融合方法。
　　針對“親和純化-質譜”技術得到的結果進行融合的問題，本文提出基于排

2、序整合與錯誤發(fā)現(xiàn)率控制的Reinforce方法。在每個排序結果均是隨機產生的空假設下，Reinforce方法通過三個步驟對多個來源不同的原始結果進行融合。首先，數(shù)據預處理步驟解決數(shù)據偏差的問題。其次，排序整合步驟使得整合后的結果更加穩(wěn)定。最后，Reinforce方法對整合結果進行錯誤發(fā)現(xiàn)率控制，從而得到高質量的蛋白質相互作用網絡。實驗結果表明，Reinforce方法能夠得到比單組數(shù)據更穩(wěn)定準確的結果。
　　針對疾病與基因關聯(lián)網絡的