非鍵作用和庫侖模型預(yù)測甘氨酸-α-多肽構(gòu)象穩(wěn)定性.pdf

1、本文采用密度泛函理論B3LYP/6-31G*方法，對甘氨酸-α-二肽、三肽、四肽、五肽和六肽分子進行了計算。對構(gòu)象中的主要非鍵相互作用進行分析，確定了影響構(gòu)象穩(wěn)定性的主要非鍵作用，并估算了相關(guān)非鍵作用的能量。將之應(yīng)用于判斷二肽、三肽、四肽、五肽和六肽分子構(gòu)象的相對穩(wěn)定性，得到了滿意的結(jié)果。進而建立甘氨酸-α-多肽的庫侖模型，探討了電荷在庫侖模型中的作用，確立了各種非鍵作用的能量參數(shù)。用本文方法及庫侖模型方法預(yù)測多肽構(gòu)象的相對穩(wěn)定性，得到

2、了滿意的結(jié)果。具體包括： 1)以甘氨酸-α-二肽、三肽、四肽、五肽和六肽分子的52個穩(wěn)定構(gòu)象為研究對象，對構(gòu)象中的主要非鍵相互作用進行分析，確定了其相應(yīng)參數(shù)值，使用此參數(shù)值和多肽分子構(gòu)象的分子結(jié)構(gòu)圖，確定構(gòu)象的相對能量，與密度泛函理論B3LYP方法得到的相對能量比較，得到了滿意的結(jié)果。 2)選擇甘氨酸-α-多肽的庫侖模型，確定相關(guān)非鍵作用能量的相應(yīng)參數(shù)K。利用庫侖模型、參數(shù)K和密度泛函理論B3LYP/6-31G*方法優(yōu)化