快速確定丙氨酸-α-多肽構(gòu)象穩(wěn)定性的新方法.pdf

1、本文采用密度泛函理論B3LYP方法，對(duì)丙氨酸-α-二肽、三肽、四肽和五肽分子進(jìn)行了計(jì)算。定義了丙氨酸多肽中的特殊氫原子，對(duì)構(gòu)象中與特殊氫原子有關(guān)的主要非鍵相互作用進(jìn)行分析，確定了其相應(yīng)參數(shù)及丙氨酸-α-多肽的庫(kù)侖模型，探討了電荷、平均電荷在庫(kù)侖模型中的作用。用本文方法快速判斷多肽構(gòu)象的相對(duì)穩(wěn)定性，得到了滿意的結(jié)果。具體包括： 1)以丙氨酸-α-二肽、三肽、四肽分子的152個(gè)穩(wěn)定構(gòu)象為研究對(duì)象，定義了丙氨酸-α-多肽中的特殊氫原子

2、，對(duì)構(gòu)象中與特殊氫原子有關(guān)的主要非鍵相互作用進(jìn)行分析，確定了其相應(yīng)參數(shù)，使用此參數(shù)和多肽分子構(gòu)象的分子坐標(biāo)或分子結(jié)構(gòu)圖，確定構(gòu)象的相對(duì)能量，與密度泛函理論B3LYP方法得到的相對(duì)能量比較，得到了滿意的結(jié)果。 2)選擇丙氨酸-α-多肽的庫(kù)侖模型，確定其相應(yīng)參數(shù)K。利用庫(kù)侖模型、參數(shù)K和密度泛函理論B3LYP/6-31G*方法優(yōu)化計(jì)算的電荷，確定構(gòu)象的相對(duì)能量，與密度泛函理論B3LYP方法得到的相對(duì)能量比較，得到了滿意的結(jié)果。計(jì)算四