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文檔簡介
1、褐飛虱(Nilaparvata lugens)是一種為害水稻生產(chǎn)的重要農(nóng)業(yè)害蟲,食性單一,只能在水稻和普通野生稻上取食和繁殖后代,但繁殖速度快且繁殖量大,是我國及許多亞洲國家水稻生產(chǎn)上的重要害蟲。本文克隆了褐飛虱DNA甲基轉(zhuǎn)移酶Dnmt3的全長cDNA,進(jìn)行了結(jié)構(gòu)與進(jìn)化分析,檢測了Dnmt3在褐飛虱整個發(fā)育階段的表達(dá)水平。分別對Dnmt1和Dnmt3進(jìn)行了RNA干擾,發(fā)現(xiàn)后代數(shù)量明顯減少,表明褐飛虱DNA甲基化對繁殖力具有一定的影響。此
2、外,還對其他翅發(fā)育相關(guān)的基因進(jìn)行了干擾分析。
1.褐飛虱Dnmt3的全長克隆及基因結(jié)構(gòu)分析
從褐飛虱轉(zhuǎn)錄組中獲得了DNA甲基轉(zhuǎn)移酶Dnmt3的基因序列片段。通過RT-PCR進(jìn)行序列片段驗(yàn)證后,利用RACE技術(shù)獲得了該基因的cDNA全長序列(GenBank登錄號為KP890855)。Dnmt3基因的cDNA序列全長為2,040個堿基,包括5'非編碼區(qū)的316個堿基,開放閱讀框的1,230個堿基和3'非編碼區(qū)的494個堿
3、基,編碼409個氨基酸。對禍飛虱Dnmt3的基因序列和蛋白序列進(jìn)行了蛋白結(jié)構(gòu)域、多序列比對、基因結(jié)構(gòu)及系統(tǒng)進(jìn)化樹分析。結(jié)果表明,褐飛虱DNMT3只含有1個具有催化活性的DNA methylase domain,不同昆蟲DNMT3的DNA methylase domain氨基酸序列相似性很高。褐飛虱DNMT3與苜蓿切葉蜂和佛羅里達(dá)弓背蟻DNMT3的相似性達(dá)到50%以上。不同物種Dnmt3基因長度相差較大,褐飛虱基因序列長度與高等膜翅目的兩
4、種蜂相近。與脊椎動物相比,昆蟲外顯子更長,但數(shù)量明顯偏少。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明,褐飛虱Dnmt3與膜翅目昆蟲同源基因具有較近的進(jìn)化距離。
2.褐飛虱Dnmt3在不同發(fā)育階段的表達(dá)分析
對褐飛虱不同發(fā)育階段的Dnmt3基因表達(dá)量進(jìn)行了分析,檢測了Dnmt3在褐飛虱1至5齡若蟲、羽化24h內(nèi)未產(chǎn)卵的長短翅雌蟲、處于產(chǎn)卵盛期的長短翅雌蟲、長短翅雄蟲中表達(dá)量的變化情況。結(jié)果表明,Dnmt3的表達(dá)量在褐飛虱若蟲階段的表達(dá)量很低,
5、而且不同齡期間的差異不明顯。在成蟲階段,不同時期存在較大差異。短翅型產(chǎn)卵盛期雌蟲表達(dá)量顯著高于長翅型產(chǎn)卵盛期雌蟲;羽化24h內(nèi)未產(chǎn)卵的雌蟲和雄蟲,短翅型表達(dá)量稍高于同一時期的長翅型,但差異不明顯。無論何種翅型,處于產(chǎn)卵盛期的雌蟲表達(dá)量均高于羽化24h內(nèi)未產(chǎn)卵的雌蟲和若蟲,雄蟲表達(dá)量最低。為進(jìn)一步明確成蟲階段的動態(tài)變化,選取1-7d不同日齡的短翅型雌蟲、短翅型雄蟲、長翅型雌蟲和長翅型雄蟲進(jìn)行表達(dá)量分析。結(jié)果表明,短翅型雌蟲表達(dá)量在整個成蟲
6、發(fā)育階段,大致呈上升趨勢,且表達(dá)量達(dá)到高峰的時期與產(chǎn)量盛期的時間大致吻合。在成蟲發(fā)育階段,短翅型雌蟲表達(dá)量顯著高于長翅型雌蟲,雄蟲的表達(dá)量最低。
3.褐飛虱Dnmt1和Dnmt3的RNA干擾分析
通過試劑盒體外合成Dnmt1和Dnmt3的dsRNA,采用顯微注射法對其進(jìn)行注射干擾,從胸部背面注射處于產(chǎn)卵盛期的雌性短翅褐飛虱體內(nèi),注射量為200nl,注射濃度為2,500 ng/μl,每只蟲子注射量大約500ng dsR
7、NA。每個重復(fù)30頭雌蟲,共三個重復(fù)。干擾注射后,30只雌蟲放置于一個燒杯中,另放置20只雄性個體供交配。與對照相比,各組試蟲在注射dsRNA后24h、48h、72h,Dnmt1和Dnmt3基因的表達(dá)量均顯著降低,表明對這兩個基因的RNA干擾都具有效果。待親代產(chǎn)卵結(jié)束后,觀察后代的個體數(shù)量,發(fā)現(xiàn)干擾Dnmt1后,后代數(shù)量極顯著減少(P<0.01);而干擾Dnmt3后,后代數(shù)量顯著減少(P<0.05)。研究結(jié)果表明,DNA甲基化與褐飛虱的
8、高繁殖力具有密切的關(guān)系。
4.褐飛虱翅發(fā)育相關(guān)基因的RNA干擾分析
從數(shù)據(jù)庫Flybase中獲得與果蠅翅發(fā)育相關(guān)的3個基因Awd,Sl和Wmd,在褐飛虱基因組中進(jìn)行同源搜索。根據(jù)褐飛虱這3個基因序列設(shè)計(jì)并合成相應(yīng)的dsRNA,選取褐飛虱2齡若蟲進(jìn)行喂食干擾實(shí)驗(yàn),dsRNA終濃度為200ng/μl。利用熒光定量PCR技術(shù)對干擾后不同時間點(diǎn)的基因表達(dá)量變化進(jìn)行檢測,結(jié)果表明,這3個基因被干擾后表達(dá)量均有明顯降低(P<0.
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