2023年全國碩士研究生考試考研英語一試題真題(含答案詳解+作文范文)_第1頁
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文檔簡介

1、丁香假單胞菌(Pseudomonas syringae)是一種已被深入研究的革蘭氏陰性植物病原細(xì)菌,但該菌對動物如秀麗隱桿線蟲(Caenorhabditis elegans)的致病性最近也已被研究證實。鐵是自然環(huán)境中最豐富的元素之一,但其生物利用率一直相對較低。多種不同的微生物類群已經(jīng)發(fā)展出具有對鐵具有高親和性能的鐵吸收系統(tǒng),包括血紅素攝取系統(tǒng)、鐵載體系統(tǒng)和細(xì)胞膜受體等。假單胞菌屬(Pseudomonas)的主要鐵載體是pyoverdi

2、ne。它是一種低分子量、高親和力的鐵清除熒光分子,僅在鐵限制條件下由熒光假單胞細(xì)菌群產(chǎn)生。除了具有對鐵的吸收性能,鐵載體pyoverdine也可以作為細(xì)菌毒素。本學(xué)位論文主要研究了基于液體培養(yǎng)條件下的線蟲致病模型中,在鐵限制條件下丁香假單胞菌野生菌株MB03和秀麗隱桿線蟲之間的相互作用,以及鐵載體pyoverdine在丁香假單胞菌致病性中的作用。
  鑒于銅綠色假單胞菌(Pseudomonas aerugionosa)PAO1菌株

3、已經(jīng)鑒定出幾乎所有與pyoverdine生物合成和分泌相關(guān)的基因,使用PAO1菌株的pyoverdin基因簇作為參考序列,利用在線工具Anti-SMASH對丁香假單胞菌MB03基因組中pyoverdine編碼基因簇進(jìn)行了預(yù)測和定位分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),發(fā)現(xiàn)丁香假單胞菌MB03中缺少5個與PAO1中的直系統(tǒng)同源基因(pvdX,pvdY,pvdA,pvdF和fpvI)。在這些基因中,pvdX和pvdY編碼調(diào)節(jié)蛋白;pvdA和pvdF編碼合成N5-

4、甲?;?N5羥基鳥氨酸殘基所需的酶,這些殘基存在于PAO1的pyoverdine的肽鏈中。但在MB03的pyoverdine基因簇中也存在一種為PAO1中所沒有的基因,即syrP。推測syrP的編碼產(chǎn)物可能參與存在于MB03-PVD肽鏈中的羥基天冬氨酸殘基的β-羥基化作用此外,在PAO1中,兩個Sigma因子編碼基因pvdS和fpvI分別參與pyoverdine生物合成和pyoverdine受體FpvA的激活,但是,在丁香假單胞菌MB0

5、3的基因組中不存在fpvI,而是在fpvA基因的前面有一個pvdS IS基因框,表明在丁香假單胞菌MB03中的pvdS可能參與fpvA基因的轉(zhuǎn)錄。
  Pyoverdine在結(jié)構(gòu)上由3個不同的結(jié)構(gòu)域組成,即生色團(tuán)(最保守的部分)、肽鏈(最可變部分)和側(cè)鏈(羧酸衍生物)。在MB03的鐵載體pyoverdine基因簇中的非核糖體基的多肽合成酶(NRPS)基因編碼參與pyoverdine的肽鏈和發(fā)色團(tuán)部分合成的一種大分子量酶。通過NRP

6、S預(yù)測因子對丁香假單胞菌MB03的5個推定的NRPS基因進(jìn)行計算機(jī)模擬表征表明,MB03-PVD的肽鏈呈線性形式并且由L-1ys,D-Asp,L-Thr,L-Thr,L-Ser,D-Asp和L-Ser。經(jīng)測定鐵載體pyoverdine特定光吸收值,發(fā)現(xiàn)MB03產(chǎn)生的pyoverdine與培養(yǎng)基中的Fe3+濃度成反比,而鐵對于pyovidine生產(chǎn)的臨界抑制濃度約為20μmol/L。
  通過使用RecTE重組系統(tǒng)來進(jìn)行pyover

7、dine生物合成2個相關(guān)基因的中斷,獲得了相應(yīng)基因中斷突變株ΔpvdD和ΔpvdJ。由于pyoverdine是一種分泌的非核糖體多肽,所以可通過LC-MS和熒光光吸收測定來鑒定中斷菌株是否喪失產(chǎn)鐵載體pyoverdine的活性。結(jié)果發(fā)現(xiàn),兩株突變株的破碎細(xì)胞濾液均缺乏pyoverdine特征性的黃綠色熒光,表明突變株未能產(chǎn)生pyoverdine。經(jīng)質(zhì)譜鑒定,2株突變株也缺乏pyovine的特征峰,而野生型MB03產(chǎn)生了具有1123.41

8、2m/z和1142.4165m/z的兩類pyovidine。
  為調(diào)查鐵在MB03對線蟲致病性中的作用,在添加或不添加鐵的M9培養(yǎng)基中來培養(yǎng)MB03菌株,然后進(jìn)行對秀麗隱桿線蟲的殺蟲生物測定。由于Pyoverdine也有助于在丁香假單胞菌中發(fā)現(xiàn)的幾種常見致病因子(如AHL,EPS和Tabtoxin)的產(chǎn)生,因此,pyoverdine有可能在培養(yǎng)過程中由于鐵在培養(yǎng)基濃度的不同從而調(diào)節(jié)了細(xì)胞毒性、并導(dǎo)致對線蟲殺蟲效果的差異性。為驗證

9、這一假設(shè),將過夜MB03培養(yǎng)物產(chǎn)生的濾液分成兩半,其中之一添加額外的100μmol/L鐵并培養(yǎng)過夜。生物測定結(jié)果發(fā)現(xiàn),野生菌株MB03導(dǎo)致供測線蟲的顯著性致死(p=0),但通過在M9中添加外源鐵(100μmol/L)或通過在MB03過夜培養(yǎng)物中直接添加外源鐵的細(xì)胞濾液可在一定程度上減小致死率。此外,液相生物測定的致死效應(yīng)通常發(fā)生在培養(yǎng)30h之后,因此,足夠的培養(yǎng)時間對于細(xì)菌的致死作用也是進(jìn)行生物測定時要考慮的。
  將基因中斷突變

10、株ΔpvdD和ΔvdJ與野生菌株MB03在貧鐵的M9培養(yǎng)基中生長后進(jìn)行液相殺蟲生物測定,另外,使用純化鐵載體pyoverdine進(jìn)行相應(yīng)生物測定,因為推測pyoverdine可能是具有殺蟲活性的MB03濾液中的一種作用導(dǎo)致線蟲死亡的活性因子。在液相生物測定中使用的純化pyoverdine的濃度與在MB9中在48h內(nèi)在M9培養(yǎng)基中產(chǎn)生的pyoverdine的濃度相當(dāng)。測量暴露于各種濾液的線蟲的相對死亡率,結(jié)果如預(yù)期相符:與M9和大腸桿菌(

11、Escherichia coli OP50濾液相比,MB03濾液顯示顯著的殺死作用(p=0),而兩種突變株的殺蟲試驗都沒有發(fā)現(xiàn)線蟲死亡。
  為了證實突變體的減毒活性是由于缺乏pyoverdine產(chǎn)生的,將純化的pyoverdine加入突變體中以測量與野生型相當(dāng)?shù)南鄬λ劳雎剩Y(jié)果證實pyoverdine是導(dǎo)致線蟲死亡的細(xì)菌濾液中的活性因子。通過pyoverdine生物合成缺陷的突變株的減毒活性、以及兩突變株在添加純化的pyover

12、dine后又可殺線蟲的實驗結(jié)果可以證實,pyoverdine在MB03介導(dǎo)的液相殺蟲實驗中是決定殺蟲活性的重要因素。此外,通過測量MB03和兩種突變株的生長曲線,發(fā)現(xiàn)突變株在貧鐵M9培養(yǎng)基中生長緩慢。因此,這表明pyoverdine對丁香假單胞菌MB03生長也是至關(guān)重要的。
  總之,本研究結(jié)果表明,丁香假單胞菌MB03具有產(chǎn)生pyoverdine的遺傳潛力。通過RecTE重組系統(tǒng)構(gòu)建獲得2株pyoverdine生物合成缺陷的基因

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