基于醫(yī)學(xué)事件的本體構(gòu)建系統(tǒng)研究.pdf

1、目前在互聯(lián)網(wǎng)上存在大量的用藥指南以及疾病治療指南等指導(dǎo)性的醫(yī)學(xué)文獻(xiàn),這些文獻(xiàn)中的醫(yī)學(xué)事件數(shù)據(jù)對(duì)于醫(yī)生用藥,監(jiān)控病人的臨床癥狀等方面有重大意義。但是,面對(duì)海量的醫(yī)學(xué)文獻(xiàn),手動(dòng)將這些自然語言描述的信息轉(zhuǎn)成機(jī)器能處理的結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)顯然不現(xiàn)實(shí)。
　　本文通過深入研究本體構(gòu)建等語義網(wǎng)的相關(guān)知識(shí),提出了一套基于醫(yī)學(xué)事件的本體構(gòu)建方案。該方案主要包括數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換,存儲(chǔ),查詢等幾個(gè)方面。本文的宗旨主要是將自然語言數(shù)據(jù)通過自動(dòng)化的解決方案轉(zhuǎn)化為機(jī)器能夠處

2、理的結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)供上層應(yīng)用使用。主要的研究方案分為以下幾步:
　　1)首先利用團(tuán)隊(duì)內(nèi)其他小組成員開發(fā)出的分詞系統(tǒng)對(duì)醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)進(jìn)行信息提取,得到半結(jié)構(gòu)化的數(shù)據(jù);
　　2)根據(jù)大量醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)總結(jié)出通用醫(yī)學(xué)事件模型,并利用該數(shù)據(jù)模型和關(guān)系-對(duì)象數(shù)據(jù)庫PostgreSQL中的二維表繼承等特性建立一套存儲(chǔ)系統(tǒng),將半結(jié)構(gòu)化的醫(yī)學(xué)事件數(shù)據(jù)存入系統(tǒng)中。
　　3)通過分析SPARQL的幾種圖匹配模式的特點(diǎn),完成SPARQL到SQL的映射關(guān)系,

3、使得用戶能夠提交SPARQL查詢到對(duì)象-關(guān)系數(shù)據(jù)庫,并返回相應(yīng)的結(jié)果集。
　　4)建立數(shù)據(jù)導(dǎo)出模塊,該模塊的主要作用是將數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)導(dǎo)成文本信息,在數(shù)據(jù)描述上,本系統(tǒng)采用命名圖模式來描述醫(yī)學(xué)事件,該模式能有效地減輕三元組描述知識(shí)的冗余度并提高查詢效率。同時(shí),命名圖能夠有效地描述不同事件之間的關(guān)系,使得不同信息之間能夠建立聯(lián)系。
　　最后,本文還通過與本體存儲(chǔ)查詢系統(tǒng)Ses ame的功能對(duì)比對(duì)該系統(tǒng)進(jìn)行評(píng)估,并得到了較好的檢