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文檔簡介
1、石榴為石榴科石榴屬落葉果樹,在食用、藥用和綠化觀賞方面具備較高的利用價值。通過構(gòu)建石榴cDNA文庫,開發(fā)EST-SSR引物,分析38個石榴品種的遺傳多樣性,繪制聚類圖,為中國石榴品種鑒定、雜交育種以及分子標記輔助育種等領(lǐng)域提供參考。本試驗結(jié)果如下:
1、以軟籽石榴品種“紅瑪瑙籽”成熟果實籽粒為材料,構(gòu)建石榴cDNA文庫,從石榴cDNA文庫中隨機挑選若干個克隆進行測序,獲得1596條石榴EST序列,處理后共得到907個Unige
2、nes序列,利用SSRIT軟件在特定條件下搜索獲得179個2到4核苷酸重復(fù)類型SSR,占所有Unigenes序列的19.7%,主要重復(fù)序列為二、三核苷酸重復(fù),占全部 SSR的95.5%。在所有二核苷酸重復(fù)序列中,(GA)n出現(xiàn)數(shù)量最多,出現(xiàn)頻率為24.0%,TG以21.2%的比例緊隨其次;所有三核苷酸重復(fù)序列中,(AGA)n、(AAG)n、(GAG)n出現(xiàn)的數(shù)量較為接近,分別以10.4%、9.0%、9.0%的比例占據(jù)前三位。
3、2、通過 Primer、DNAman等軟件進行引物設(shè)計,在設(shè)定條件下共設(shè)計20對引物,并通過白玉石籽、泰山紅、皮山2號這3個不同產(chǎn)地的石榴品種進行篩選,篩選得到10對得到預(yù)期片段的引物。
3、使用聚丙烯酰胺凝膠電泳試驗檢測38個石榴品種,篩選得到8對引物,具有較高的多態(tài)性。利用這些引物對38個石榴品種進行多態(tài)性分析,平均檢測出2.60個條帶;觀測雜合度的范圍為0.125~0.833,(平均0.367);多態(tài)信息含量值的范圍為0
4、.080~0.664(平均0.377)。
4、對這些新開發(fā)的標記進行遺傳相似性和聚類分析,38個石榴品種的遺傳相似性系數(shù)為0.68~0.97,平均為0.83,這說明供試石榴品種間遺傳相似性較高。由聚類圖可知,在相似性系數(shù)0.68處,38個石榴品種可劃分為兩大組,分別是以安徽品種為主的組I和以山東品種為主的組II,說明兩地的石榴品種具有不同的遺傳背景;組I在相似性系數(shù)為0.80條件下又分為3個亞組(I-A、I-B、I-C),其中
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