青蝦高多態(tài)性EST-SSR標記的篩選及遺傳多樣性的研究.pdf

1、青蝦，學名日本沼蝦（Macrobrachiumnipponense），是我國重要的淡水養(yǎng)殖蝦類。由于青蝦具有脫殼的生物學特性，活體標記比較困難，而分子標記作為以DNA多態(tài)性為基礎的遺傳標記，已被廣泛應用于遺傳多樣性分析、群體與種質(zhì)鑒定、親緣關系研究、性狀相關標記篩選等方面。微衛(wèi)星標記作為第二代分子標記由于其具有多態(tài)性好、共顯性遺傳等特點，在遺傳學和遺傳育種研究中備受青睞。因此在青蝦中篩選適合作為其種質(zhì)資源鑒定的分子標記是十分必要的。黃河

2、、長江、珠江三大河流中，青蝦資源較為豐富，調(diào)查分析三個青蝦群體的遺傳多樣性對資源保護和科學利用都有著重要的意義。
　　本研究通過對青蝦NCBI-EST文庫（LIBEST_027335oftestiscDNAlibrary;LIBEST_023572ofovarycDNAlibrary）進行微衛(wèi)星序列的查找，針對搜索得到的微衛(wèi)星序列設計引物，以太湖野生青蝦群體為模板進行擴增，按照衡量基因變異程度高低的多態(tài)信息含量指標篩選出具有高度多

3、態(tài)性(PIC＞0.5)的14個EST-SSR標記。檢測到的等位基因數(shù)(Na)為4到13;觀察雜合度(Ho)從0.4125到0.8938;期望雜合度(He)從0.6786到0.9332;多態(tài)信息含量(PIC)從0.613到0.899。
　　利用本研究篩選得到的EST-SSR標記，并結(jié)合原來實驗室開發(fā)的微衛(wèi)星標記，確定其中的20個標記對黃河、長江、珠江三大河流的青蝦群體進行了遺傳多樣性分析。結(jié)果表明:黃河、長江、珠江三個青蝦群體等位基

4、因數(shù)(Na)分別為6.5500、5.2500、5.7000;20個位點平均多態(tài)信息含量(PIC)為0.7876;3個群體觀測雜合度(Ho)分別為0.4481、0.5013、0.4127;3個群體期望雜合度(He)分別為0.5210、0.5536、0.6529，表明三條河流青蝦遺傳多樣性都較為豐富;期望雜合度由高到低依次為:珠江、長江、黃河。分子方差分析(AMOVA)結(jié)果顯示，青蝦3個群體間5.3％遺傳變異來自群體間，94.7％來自群體內(nèi)

5、，兩兩群體間Fst值在0.0298-0.0552之間，表明群體間已明顯出現(xiàn)分化(P＜0.05)，但分化程度中等。3個群體間的遺傳相似系數(shù)為0.8162到0.9143之間;3個群體間遺傳距離在0.0898-0.1530之間，其中黃河與珠江群體遺傳距離較遠為0.1530，珠江與長江群體遺傳距離最近為0.0898。黃河與長江群體遺傳距離為0.1028。
　　本文篩選了高度多態(tài)性的青蝦微衛(wèi)星位點，為青蝦提供了新的分子標記;對黃河、長江、珠