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文檔簡介
1、組蛋白去乙?;?HDACs)是一個超基因家族,在真核生物(包括酵母、哺乳動物和植物)中廣泛存在。HDACs與組蛋白乙酰基轉(zhuǎn)移酶(HATs)共同作用來調(diào)節(jié)組蛋白乙?;臓顟B(tài),從而影響染色體的結(jié)構(gòu)和功能,調(diào)節(jié)基因的轉(zhuǎn)錄和細胞的多種功能。目前,人們對植物HDACs的研究逐漸增多,很多HDAC基因在不同植物中得到鑒定和研究。研究表明HDACs與植物發(fā)育和脅迫反應有關。目前,人們對木本植物HDAC基因家族的特性和功能了解甚少,相關研究未見報道。
2、
本論文分析了毛果楊HDAC基因家族的性質(zhì),以及在低溫脅迫下的表達模式。我們的研究結(jié)果表明:
1.HDAC家族的15個基因主要定位在第1、4、5、6、9、12和15七條染色體上,僅僅HDA912目前還未確定。理化性質(zhì)分析表明HDAC家族大多數(shù)成員為親水性蛋白質(zhì)(HDA912屬于疏水性蛋白),其等電點呈酸性(除了HDA912和SIR2亞家族)。細胞定位分析顯示HDAC家族蛋白在細胞內(nèi)分布比較廣泛,但主要定位于細胞核,尤
3、其是HD2亞家族,幾乎都定位在細胞核內(nèi)。HDAC受磷酸化調(diào)節(jié),蛋白磷酸化位點主要發(fā)生在絲氨酸殘基上,HD2亞家族在酪氨酸殘基處僅有一處發(fā)生。二級結(jié)構(gòu)分析顯示,RPD3/HDA1亞家族成員(除了HDA912)和SIR2亞家族成員無規(guī)則卷曲比例都在50%以上,而HD2亞家族成員的α-螺旋比例為0,無規(guī)則卷曲比例在80%左右。進化樹分析顯示毛果楊HDAC家族成員可以分為3個亞家族,即RPD3/HDA1亞家族、HD2亞家族和SIR2亞家族,這與
4、擬南芥和水稻HDAC家族的分類是一致的。
2.HDACs家族基因在葉、莖、根中均有表達,不同家族成員表達水平不同。有些基因(如HDA902、HDA903、HDT901和HDT902)在根、莖、葉中表達量相對較高;有些基因(如HDA901、HDA912、HDT903和SRT901)主要在葉或莖中表達,在根中表達量相對較低。
3.低溫脅迫能夠影響毛果楊HDAC基因的表達,大部分HDAC基因的表達受低溫誘導,只有少部分基因
5、表達不受低溫影響或受低溫抑制。HDAC基因主要在低溫處理3天時明顯誘導表達,其中HDA902、HDA903、HDA904、HDA908、HDA909、HDA912、HDT901、HDT902和HDT903這些基因表達水平上調(diào)了2倍以上。莖或根中HDA901,HDA910和SRT901基因的表達受低溫的抑制。當?shù)蜏孛{迫解除后,HDAC基因的表達基本恢復到處理前的水平。此外,HDAC特異性抑制劑TSA能夠影響CBF2等與低溫脅迫相關的基因的
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