DNA編碼序列檢測(cè)的優(yōu)化算法設(shè)計(jì).pdf

1、DNA編碼序列的檢測(cè)是隨著海量生物基因信息的出現(xiàn)而出現(xiàn)的，利用數(shù)字信號(hào)處理快速高效的優(yōu)點(diǎn)，根據(jù)DNA編碼序列的特征設(shè)計(jì)專(zhuān)門(mén)的檢測(cè)方法，目前已經(jīng)得到了長(zhǎng)足的發(fā)展。
　　 針對(duì)傳統(tǒng)編碼序列檢測(cè)算法中大多存在的單純依賴(lài)周期3特性、補(bǔ)零延拓對(duì)幅頻響應(yīng)能量零貢獻(xiàn)、校正不精確等不足，本文提出了結(jié)合堿基含量的雙端周期延拓周期3編碼序列檢測(cè)算法，增強(qiáng)了檢測(cè)曲線(xiàn)的指示性，進(jìn)一步提高了檢測(cè)算法的準(zhǔn)確性和健壯性。
　　 結(jié)合DNA編碼區(qū)規(guī)則，

2、本文對(duì)檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行了進(jìn)一步甄別和優(yōu)化，對(duì)數(shù)據(jù)集HMR195進(jìn)行測(cè)試表明：在核苷酸水平檢測(cè)結(jié)果的ROC指標(biāo)率達(dá)到86.87％，明顯高于當(dāng)前的處理效果。實(shí)驗(yàn)結(jié)果證實(shí)該組合算法進(jìn)一步校正了位置偏移，結(jié)合CG含量和編碼區(qū)規(guī)則等先驗(yàn)信息的方法在不增加時(shí)間復(fù)雜度的同時(shí)，優(yōu)于現(xiàn)存AMDF、TDP等最優(yōu)時(shí)、頻域檢測(cè)方法。
　　 最后，基于本文提取的編碼序列特征，設(shè)計(jì)了支持向量機(jī)(SVM)分類(lèi)器。對(duì)數(shù)據(jù)集HMR195中的DNA序列進(jìn)行了核苷酸級(jí)別