用生物統(tǒng)計方法預測蛋白質相互作用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、⑧申請同濟大學理學碩士學位論文用生物統(tǒng)計方法預測蛋白質相互作用(國家自然科學基金項目編號:20675057)培養(yǎng)單位:一級學科:二級學科:研究生:指導教師:化學系化學分析化學胡佳李通化教授二oo七年三月摘要第一部分系統(tǒng)地介紹蛋白質相互作用的原理、相關的數(shù)據(jù)庫以及目前鑒別蛋白質相互作用的主要的研究方法。第二部分介紹了本文的實驗數(shù)據(jù)來源、特點和實驗數(shù)據(jù)的分析、預處理以及結果的評價方法。第三部分首先簡單介紹支持向量機(sVM)的相關知識,再提

2、出了基于蛋白質序列的五種不同的編碼方法,分別是CTD編碼、氨基酸單編碼、氨基酸雙編碼、Gauss函數(shù)分布編碼方法和偽氨基酸編碼。并結合SVM進行建模和預報,進一步優(yōu)化改進這些編碼方法,分析預報結果以及編碼思想之間的聯(lián)系。第四部分提出了雙層SVM的概念。利用不同的特征和分類器之間的互補,形成兩層的SVM融合網絡模型,將多個子分類器進行組合,再用SVM進行預測。在本文的末尾,我們對預測工作進行了總結,對工作中的不足之處進行了探討,并提出了一

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