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文檔簡介
1、目的:分析15個常染色體短串聯(lián)重復(fù)序列(Autosomal Short Tandem Repeat)和10個Y染色體短串聯(lián)重復(fù)序列(Y-chromosomal Short Tandem Repeat, Y-STR)基因座及其單倍型在陜南漢族人群的基因多樣性分布,豐富中華民族STR遺傳信息資源,并基于已發(fā)表的族群遺傳數(shù)據(jù),探討了陜南漢族和其他民族群體之間的遺傳關(guān)系,并為法醫(yī)學(xué)及其相關(guān)研究提供依據(jù)。
方法:采用Expressmar
2、ker16+10Y(EX16+10Y)熒光檢測體系,對陜南漢族214個健康、無關(guān)個體的15個常染色體STR基因座、Amelogenin和10個Y染色體STR基因座進行多重復(fù)合擴增,用ABIPRISM3130遺傳分析儀對PCR擴增產(chǎn)物進行檢測分型。從數(shù)據(jù)庫中下載其他17個民族的15個常染色體STR和17個Y-Filer(AmpFISTR Y-FilerTM)基因座的分型數(shù)據(jù),結(jié)合本研究中陜南漢族的數(shù)據(jù),利用軟件ARLEQUIN進行分子方差
3、分析,利用軟件DISPAN計算遺傳距離DA,利用軟件MEGA和PHYLIP分別進行系統(tǒng)發(fā)育樹分析,利用軟件MVSP進行主成分分析。
結(jié)果:研究獲得陜南漢族15個常染色體STR和10個Y-STR基因座的分型數(shù)據(jù),15個常染色體STR基因座在214個無關(guān)個體中發(fā)現(xiàn)150個等位基因,等位基因頻率分布在0.0023-0.5210,累計個體識別率和非父排除率分別為0.999999999999999998869和0.999998491。陜
4、南漢族108個男性個體中,共發(fā)現(xiàn)100種單倍型,其中僅出現(xiàn)一次的Y-STR單倍型94個,Y-STR單倍型多樣性為0.9983。Y-STR基因座除了DYS391和DYS438以外,其余8個基因座的遺傳多樣性值(Gene Diversity,GD)均在0.5以上,具有高度遺傳多樣性。對陜南漢族和其他17個群體的遺傳關(guān)系研究顯示,陜南漢族和華東漢族在25個STR基因座的等位基因頻率分布上均無統(tǒng)計學(xué)差異,表現(xiàn)出相對較近的群體遺傳關(guān)系;然而陜南漢
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