福建漢族人群常染色體STR基因座等位基因突變分析及插入-缺失多態(tài)性位點在親權(quán)鑒定中的應(yīng)用探討.pdf

1、目的：觀察福建漢族5453個STR基因座分型結(jié)果為不排除親權(quán)關(guān)系的案例，分析福建漢族人群STR基因座等位基因突變規(guī)律，計算親權(quán)指數(shù)，探討STR基因座等位基因突變對親權(quán)鑒定結(jié)果判定的影響；探討插入/缺失多態(tài)性位點在法醫(yī)親權(quán)鑒定中的應(yīng)用價值。
　　方法：（1）采用四種常用的常染色體STR檢測系統(tǒng)（IdentifilerTM、SinofilerTM、PowerP lex16、PowerP lex21），在5453個三聯(lián)體和二聯(lián)體中篩選1

2、～2個STR等位基因不符合遺傳規(guī)律的案例，通過增加STR檢測系統(tǒng)復(fù)核，確認(rèn)突變事件，統(tǒng)計各STR基因座等位基因突變率，分析突變規(guī)律及特點，以所得突變率計算PI值。
　　（2）將331個STR基因座分型結(jié)果為肯定親權(quán)關(guān)系、排除親權(quán)關(guān)系和懷疑存在STR等位基因突變的案例分為三組，采用QIAGEN公司Investigator DIPplex系統(tǒng)進行插入/缺失多態(tài)性（insertion-deletion polymorphisms，InD

3、els）位點檢測，將結(jié)果與STR分型結(jié)果進行比較；統(tǒng)計不符合遺傳規(guī)律位點數(shù)量，繪制頻數(shù)分布圖；統(tǒng)計30個InDels位點的不符合遺傳規(guī)律次數(shù)及排除率。
　　結(jié)果：（1）5453個親權(quán)鑒定案例共檢出17個STR基因座的114次等位基因突變事件。統(tǒng)計17個基因座的突變率，平均突變率為0.112％。比較得基因座間突變率存在顯著差異（p<0.01），突變率隨著最大同一連續(xù)重復(fù)次數(shù)(the longest run of perfect re

4、peats,LRPR)幾何均數(shù)的增加而增加。
　?。?）STR突變事件除1例3步突變外，其余均為1步突變。其中53例為增加重復(fù)單位，47例為減少重復(fù)單位，兩者間差異無統(tǒng)計學(xué)意義（p>0.05）。
　　（3）父源性突變92次（80.7%），母源性突變17次（14.9%），無法確定突變來源的5次（4.38%）；父源性突變:母源性突變=5.41:1，差異有統(tǒng)計學(xué)意義（p<0.01）。
　?。?）所有STR突變案例CPI值均>

5、1；三聯(lián)體案例中CPI<10000的案例有27例（32.53%），CPI值在10000~100000的案例占50%。二聯(lián)體案例中CPI<10000的案例有11例（39.29%）。
　　（5）確定了2例STR基因座等位基因丟失現(xiàn)象。
　　（6）Investigator DIPplex檢測系統(tǒng)在基因分析儀上能夠獲得清晰、明確的分型結(jié)果，共檢測出5色熒光標(biāo)記的30個InDels位點，可明顯分辨出純合子及雜合子基因型。
　?。?/p>

6、7）所有不符合遺傳規(guī)律的三聯(lián)體或二聯(lián)體的InDels位點基因型均至少包含2個純合子。109例排除親權(quán)關(guān)系三聯(lián)體InDels位點檢測均出現(xiàn)不符合遺傳規(guī)律位點。100例排除親權(quán)關(guān)系二聯(lián)體中，有9例30個InDels位點全部符合遺傳規(guī)律；91例出現(xiàn)不符合遺傳規(guī)律位點。
　?。?）22例懷疑STR基因座等位基因突變案例，經(jīng)30個InDels位點檢測，確定1例為排除，其余21例均未出現(xiàn)不符合遺傳規(guī)律位點。
　　結(jié)論：（1）福建漢族人群

7、各STR基因座間突變率存在較大差異，突變率與基因座核心序列的重復(fù)次數(shù)呈正相關(guān)；增加突變與減少突變的概率相同，STR突變父源性多于母源性。
　?。?）以本研究所得突變率計算PI值，CPI<10000案例數(shù)量大于30%，提示考慮突變的情況下15～20位點STR檢測判斷鑒定結(jié)果仍具風(fēng)險。
　?。?）檢出等位基因丟失案例，提示在懷疑突變情況下，親代、子代均為純和子案例應(yīng)更換引物系統(tǒng)做進一步檢測，以防誤判。
　?。?）InDel