個人基因組數(shù)據(jù)可視化研究與實現(xiàn).pdf

1、隨著測序成本的下降,測序數(shù)據(jù)越來越多,以后每個人都會有自己的基因組數(shù)據(jù),個人基因組時代即將到來。而這個時候限制基因組研究不在是數(shù)據(jù)的產(chǎn)生,而是數(shù)據(jù)的分析,基因組數(shù)據(jù)可視化工具有利于研究人員理解基因組數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)之間的關系。特別是對個人基因組數(shù)據(jù)的分析,可以為每一個人提供一些關于個人的信息。
　　現(xiàn)有的可視化系統(tǒng)分為web-based和local兩種形式,由于基因組數(shù)據(jù)量特別大,存儲在個人PC機上非常占用空間,這些數(shù)據(jù)一般都存在服

2、務器端,而且網(wǎng)絡帶寬不斷增大,所以本系統(tǒng)采用web-based結構,這也符合當前的“云時代”。
　　可視化工作是在前端完成的,把大量的計算分配給用戶的電腦,減輕服務器端的負載,用canvas技術實現(xiàn)。本系統(tǒng)實現(xiàn)了人類基因組數(shù)據(jù)、序列比對結果數(shù)據(jù)、基因注釋數(shù)據(jù)、變異數(shù)據(jù)和數(shù)值類型的數(shù)據(jù)在不同模式的可視化。并且這些模式可以根據(jù)查看的范圍的自動進行轉換,具有語義化的特點。
　　本系統(tǒng)對于個人基因組數(shù)據(jù)的可視化是以個人的變異數(shù)據(jù)為中