病毒基因組生物信息可視化系統(tǒng)研究.pdf

1、隨著人類基因組計劃的初步完成，生物信息學的研究重點已悄然的從生物數據的積累轉到生物數據的處理和信息提取。然而，在對DNA序列的研究過程中，代數學范疇的傳統(tǒng)分析方法難以發(fā)揮人腦在模式識別方面的強大能力。本文以病毒基因組為研究對象，對其通用模型、序列Z曲線的構建、圖形數據庫建立等進行了研究。并在此基礎上，構建新城疫病毒(Newcastle Disease Virus，NDV)生物信息可視化系統(tǒng)，具體研究內容如下： 1.核酸序列Z曲線

2、構建研究。主要在對經Z變換得到的空間數據點分析的基礎上，給出一種基于包圍盒的抽稀方案，應用該方案動態(tài)調整抽稀因子，實現(xiàn)對核酸序列所含生物遺傳信息的多精度顯示。實驗表明，該方案既能對全基因組序列進行整體研究，又能對個別重要基因展開細節(jié)鉆研，為序列同源性比較和分子進化研究提供了新思路。 2.基于C/S模式的生物信息可視化系統(tǒng)模型研究。在總結給出生物信息可視化系統(tǒng)的一般工作流程的基礎上，對傳統(tǒng)C/S模式進行研究，提出一種基于C/S模式

3、的生物信息可視化結構模型，該模型解決生物核酸序列數據的轉換、處理、顯示、分析等問題。 3.NDV生物信息數據庫的建立。針對不同格式序列文件結構、Z變換后的空間數據點數據結構、曲線屬性數據結構，建立NDV生物信息數據庫。通過矢量化曲線圖，建立NDV病毒基因組核酸序列Z曲線圖形數據庫；然后建立核酸序列數據庫；最后，實現(xiàn)圖形數據庫和序列數據庫的掛接。 4.生物信息可視化系統(tǒng)實現(xiàn)與應用。重點研究基于C/S模式的NDV生物信息可視