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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
探究基因編輯工具剪切效率和脫靶效應(yīng)評(píng)估新方法,開(kāi)發(fā)新的基因編輯工具剪切效率和脫靶效應(yīng)評(píng)估新體系。
方法:
選取質(zhì)粒中博來(lái)霉素抗性基因作為實(shí)驗(yàn)候選報(bào)告基因。在原核系統(tǒng)構(gòu)建Amp-Zeocin雙抗質(zhì)粒。同時(shí)在Zeocin抗性基因起始密碼子ATG與第二密碼子GCC間加入BaeI酶切位點(diǎn),可實(shí)現(xiàn)金門克隆插入核酸片段方法。在真核體系構(gòu)建G418/Kana-Zeocin雙抗質(zhì)粒,同時(shí)也在Zeocin抗性基因起始
2、密碼子ATG與第二密碼子GCC間加入BaeI酶切位點(diǎn),可實(shí)現(xiàn)金門克隆插入核酸片段方法。在候選報(bào)告基因中加入不同長(zhǎng)度(包括3的整數(shù)倍和非3的整數(shù)倍)、不同種類(含有終止密碼子和不含有終止密碼子,指定序列和任意序列)的核酸片段,觀察其抗性的保留與否;將人工構(gòu)建的失活抗性基因使用基因編輯工具造成雙鏈斷裂,加入同源oligo,促使其在E.coil中發(fā)生同源重組重新恢復(fù)活性,驗(yàn)證其抗性功能的轉(zhuǎn)換能力。
結(jié)果:
成功構(gòu)建雙抗質(zhì)粒
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