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文檔簡介
1、骨髓增生異常綜合癥(Myelodysplastic Syndrome, MDS)的發(fā)病與基因突變有密切的關(guān)系,正常造血干細胞進展成為白血病細胞是一個累及多個基因的病理過程。本課題是第一個使用全基因組測序的方法,在造血干/祖細胞水平上對8個MDS-Refractory Anemia with Excess Blasts(RAEB)患者初發(fā)骨髓CD34+細胞以及皮膚組織細胞作為正常對照的配對樣本進行全基因組測序,篩選出105個影響蛋白編碼序
2、列的突變位點。MDS測序結(jié)果與已報道的AML(Acute Myelocytic Leukemia)進行比較分析,發(fā)現(xiàn)它們有相同的堿基替換模式,但突變基因類型卻不同:信號傳導(dǎo)途徑和激酶基因突變在MDS中少見,剪切體基因突變在MDS樣本中遠高于AML,兩者從遺傳圖譜上看是屬于同一種疾病,可能為疾病的不同階段。本文也第一次用實驗證明了MDS患者在造血干/祖細胞階段就存在分化阻滯,也得到5例樣本白血病細胞克隆演進的分析圖。
急性淋巴細
3、胞白血病(Acute Lymphoblastic Leukemia, ALL)外顯子測序結(jié)果顯示BCR-ABL1和epigenetic mutatios可能存在互斥性。對25例做過外顯子測序的ALL樣本用RNAseq進行轉(zhuǎn)錄組分析,發(fā)現(xiàn)BCR-ABL1和epigenetic mutations組表達譜存在相似性和異質(zhì)性。同帶有TCF3-PBX1融合基因的樣本進行差異基因分析,發(fā)現(xiàn)BCR-ABL1和epigenetic mutations
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